摩氏摩根菌噬菌体MmP1内溶素基因预测、克隆、表达及生物学活性的初步研究

来源 :第三军医大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:wupei0083
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
摩氏摩根菌是革兰阴性菌,属肠杆菌科,有3个亚种,M. morganii、M. sibonii.和Morganella psychrotolerans,存在于环境中,以及人类、爬行动物和哺乳动物的肠道内。摩氏摩根菌是引发院内感染的重要病原菌之一。噬菌体作为细菌的病毒,是微生物中的非细胞形态的低级生命形式,它在自然界中广泛存在,是生物圈中数量最多的生命形式。本实验室已完成摩氏摩根菌噬菌体MmP1的全基因组测序及初步的基因组注释,并已在GenBank上登录(No. EU652770)。噬菌体是以细菌为宿主的病毒,能够特异性的感染和裂解细菌。噬菌体感染宿主菌时,要穿过细菌细胞壁肽聚糖层,或者将其核酸注入到宿主菌体内进行复制。而噬菌体完成复制、组装后,又需破坏宿主菌肽聚糖层,释放子代噬菌体,进行下一步的感染。而控制双链DNA噬菌体进入宿主细胞的物质是一种由噬菌体编码的蛋白,称作内溶素或溶素(Endolysin or Lysin)。内溶素是一种可以破坏宿主菌细胞壁肽聚糖的酶蛋白。因此,在对抗生素耐药性越来越明显的情况下,内溶素有可能成为某些致病细菌的潜在抗感染药物。通过基因预测及BLAST分析,我们推定摩氏摩根菌噬菌体MmP1基因组的ORF12编码内溶素基因。因此本文首先从生物信息学的角度对该基因编码产物的氨基酸序列进行结构分析,随即克隆MmP1内溶素基因,并成功构建了重组质粒,然后表达、纯化得到重组蛋白,进一步分析重组蛋白对底物肽聚糖的降解活性及抑菌作用,通过实验验证了内溶素的基本生物学活性。其研究内容和结果主要有以下几个方面:1.摩氏摩根菌噬菌体MmP1内溶素氨基酸序列与结构的分析:通过BLAST检索获得推定的摩氏摩根菌噬菌体MmP1内溶素的同源蛋白,分子系统发生进化分析提示摩氏摩根菌噬菌体MmP1内溶素与噬菌体K11溶菌酶的进化距离最近,二者可能来源于同一祖先序列;蛋白质结构预测结果显示MmP1内溶素具有与T7酰胺酶相似的二级结构与三级结构,并含有由His17、Tyr46、His122、Lys128及Cys130构成的活性中心,该结果提示MmP1内溶素可能为一种具有N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶活性的锌酰胺酶。2.摩氏摩根菌噬菌体MmP1内溶素全长基因的克隆:通过对PCR反应体系与条件的优化,扩增到了内溶素全长结构基因,并将其插入原核表达载体pQE31中,成功构建了内溶素重组质粒pQE31-M12。该重组质粒经BamHⅠ和sal I双酶切鉴定后,对重组质粒进行核苷酸测序,结果表明重组质粒的序列和阅读框均正确。3.摩氏摩根菌噬菌体MmP1内溶素全长基因的表达与纯化:将重组质粒转化大肠埃希菌JM109,获得了表达稳定的基因工程菌,并优化了表达条件。该表达菌经过超声裂解及SDS-PAGE电泳,确定目的蛋白为分泌型表达,故对融合蛋白上清行非变性的Ni-NTA柱亲和层析以及分子筛层析纯化后,获得单一条带的目的蛋白。Lowry法测定目标蛋白浓度为4.964 mg/ml。4.重组融合蛋白的降解活性测定:提取摩氏摩根菌细胞肽聚糖成分,采用酶谱电泳法、扩散法检测重组融合蛋白(浓度为10mg/ml)对细胞壁肽聚糖层的降解活性,结果显示重组融合蛋白对摩氏摩根菌肽聚糖具有显著降解作用。5.重组融合蛋白抑菌活性研究:通过扩散法,利用重组融合蛋白(浓度为20mg/ml)分别处理革兰阳性菌(金黄色葡萄球菌)和革兰阴性菌(铜绿假单胞菌和摩氏摩根菌),结果显示目的蛋白只对金黄色葡萄球菌具有抑制现象,而对革兰阴性菌没有抑制现象;进一步测得重组融合蛋白的MIC值为0.39μg/ml,并将其与三种抗生素(新青Ⅱ、Amp、Car)协同作用,结果提示重组融合蛋白可显著增强这三种抗生素对金黄色葡萄球菌的抑菌活性。综上所述,本研究首先通过序列与结构分析提示摩氏摩根菌噬菌体MmP1内溶素可能为一种具有N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶活性的锌酰胺酶;然后对MmP1内溶素基因进行了克隆和表达,并通过非变性的Ni-NTA柱亲和层析以及分子筛层析,获得了纯化的重组融合蛋白;获得的融合蛋白经体外活性检测证实,对摩氏摩根菌细胞壁肽聚糖具有一定的降解活性,并且对金黄色葡萄球菌活菌具有一定的抑菌活性,并且与新青Ⅱ、Amp、Car等抗生素联合使用具有协同抑菌效果。本研究结果为进一步研究该内溶素的功能、作用机制及其在临床上各种抗感染治疗中的潜在运用奠定了一定的基础。
其他文献
有效教学是教师们一直追求的方向,实现有效教学.能够提高学生学习的效率.减轻教师的教学负担。根据不同学科的具体要求.教学的方式会有所不同。对于小学语文教学而言.有效教学更应
本文将多变量总体最优化问題转化为单变量总体最优化问題来求解,并利用隧道法来加快求解速度。
在新课程理念指引的今天,在语文阅读教学中.我们可以通过创设生动的教学情境,让学生在乐趣中学习。我们可利用多媒体激发学生参与的兴趣,让学生做课堂的主人:通过培养学生良好的读
研究的关键问题主要包括:1 把握好教学改革的科学性,遵循循序渐进的原则,积极稳妥地做好专业拓宽, 但必须辩证地对待原有的专业基础;正确处理好专业知识的深度与广度的平衡性
本文推广了文献[1]—[5]中 Schweitzer 不等式、Gr(?)ss 不等式,也指出这两类不等式的关系.
引力场的非线性性影响行星的轨道,最重要的影响是使轨道发生进动,本文计算的进动值为△θ=(π/2)(βGM/C^2/L).
【正】 1.前言竞赛规则是竞技体育比赛的规范和准则,是每个参赛者都必须遵守的法则。竞赛规则发展变化的原因及规律以及对技、战术发展的影响,确定了隔网项群竞赛规则的改变
20世纪末至21世纪初被称为“移民时代”。在这个“移民时代”,各国家技术、商品、文化、信息、劳务等流通性越来越强,世界人口迁移在这种全球化进程日益深入的大背景下越发的
<正> 中国高等学校自然科学学报研究会体育院校学报研究会第二届学术年会,于1989年11月1日至6日在福建体育学院圆满结束。参加这届年会的有广州、山东、上海、天津、中国人民解放军、成都、河北、武汉、哈尔滨和福建等体育院校学报编辑部的代表。
随着生活水平的日益提高,健康已经成为人们越来越关注的问题,因此准确测量皮下脂肪组织和内脏脂肪组织含量对许多疾病的研究具有重要的意义。核磁共振成像中的IDEAL-IQ技术是一种主要用于对扫描部位的脂肪组织进行成像的安全、无痛的检查方法,并在一次扫描中生成六种序列。经过数十年的发展,计算机辅助诊断技术已经成为一个综合运用了多种先进技术的临床医学诊断工具。在计算机辅助诊断涵盖的众多算法中,机器学习正成为