湖羊CRY1基因选择压力和核心启动子结构研究

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绵羊作为短日照动物,通常在秋冬季节集中发情,在次年春天集中产羔。这种季节性繁殖的特性限制了其繁殖效率,从而极大地限制了肉羊出栏量。因此,研究季节性繁殖的内在原因至关重要。CRY基因与哺乳动物季节性繁殖密切相关,本研究以哺乳动物CRY为研究对象,分析其起源与分化,以及在季节性繁殖哺乳动物中的选择压力。从转录水平分析CRY1基因在湖羊初情期前后性腺轴中的变化,并研究了CRY1基因的核心启动子区。主要结果如下:(1)系统发育树分析表明,CRY1和CRY2基因可能是第二轮全基因组复制的产物;蛋白结构分析表明CRY家族发生了明显分化,CRY1蛋白C端α螺旋的长度在进化过程中缩短。(2)通过Codeml程序的分支和位点模型分析CRY基因在哺乳动物间受到的选择压力。结果显示:哺乳动物CRY1和CRY2支系均受到纯化选择;CRY1蛋白的558氨基酸位点在季节性繁殖哺乳动物间受到正选择作用,该位点在77.8%的短日照动物中是苏氨酸(Thr),在60%的长日照动物中是蛋氨酸(Met);生物信息学分析表明558位点从T到M的突变会缩短CRY1蛋白质C端的α螺旋和影响蛋白的疏水性;FRAP试验证明绵羊M558蛋白的入核速率极显著高于T558(p<0.01)。(3)转录组分析表明:CRY家族在湖羊性腺轴均有表达,CRY1基因在湖羊初情期睾丸组织内的表达量显著上调(p<0.05)。蛋白互作网络分析表明,CRY1蛋白可能与PPP2R1B和USP2蛋白互作进而参与湖羊初情期的精子发生。(4)通过比较基因组学和构建CRY1基因5’端缺失片段载体分析双荧光素酶活性的方法,确定湖羊CRY1基因的核心启动子区位于起始密码子上游-1160/-958 bp。(5)转录因子TCFL5/NRF1结合位点突变试验结果表明,TCFL5/NRF1结合位点(-1033/-1024 bp)可以显著影响CRY1基因核心启动子的活性(p<0.001);转录因子TCFL5过表达后,其核心启动子的活性极显著升高(p<0.01)。EMSA试验结果表明,转录因子TCFL5可能与CRY1基因核心启动子结合。通过荧光定量PCR的方法发现TCFL5和CRY1基因在湖羊睾丸内的转录水平呈正相关(p<0.01)。
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