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研究目的通过分析福建省参合农民住院补偿情况及其对新农合的看法，了解新农合制度对农民医疗费用负担及就医行为的影响，探讨新农合缓解农民“看病难、看病贵”的效果，为进一步完善有关政策，促进新农合可持续发展提供科学依据。研究方法运用SPSS15软件对福建省2004―2012年新农合住院补偿数据库进行描述性分析，并利用新农合相关报表和政策文件进行分析，对440个农民进行问卷调查及对部分参合农民进行访谈，探讨新农合制度对农民医疗费用负担及就医行为的影响因素。研究结果①2004―2012年新农合患者次均住院费从3151元增加到5375元，增长70.6%；次均补偿额从934元增加到2546元，增长172.6%；实际补偿比从29.6%增加到47.3%，但农民仍需自付53%左右的费用；随着参合农民人均收入的增加，自负住院费用调整值从0.54下降到0.29，这些指标各地差别明显。②近5年超高额费用患者人数逐年递增，年增长率达42.1%，其自付住院费用调整值虽逐年下降，但最低的2012年，其自付住院费用仍高达农民年人均收入的27.3倍。③参合患者到县外住院的占比，从2004年的22.1%上升到2012年的30.0%,其总住院费用占62.57%。④“次均住院费”的主要影响因素依次是到“县外住院”、“县级住院”、“自付药品费”、“其他自付费用”；“实际补偿比”的主要影响因素是“人均筹资额”（运行年份）、“到县外住院”、“县级住院”和“范围外费用占比”等。研究结论与政策建议福建省2004―2012年新农合患者的次均住院费用逐年增长，随着人均筹资基金额的增加，次均补偿额和实际补偿比也逐年增加，因此自付住院费用调整值逐年降低，参合农民住院医疗负担有所减轻，但超高额费用患者的负担仍较重；目前到县及县以上大医院住院的病人逐年增多，一定程度上导致了总体次均住院费上涨且制约实际补偿比的提高。建议加强费用控制，提高筹资水平，提高基层医疗卫生机构的服务能力，加强对基本药物制度及新农合药品目录的管理，并建立健全医疗机构的分级转诊制度，对高额医疗费用负担的参合农民采取额外补助，以发挥新农合制度更大的惠民作用。