马生长激素基因克隆及部分序列的PCR-SSCP研究

来源 :内蒙古农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tanhuanghehuanggua
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本研究以不同品种马为研究对象,利用 PCR 技术,首次成功地克隆了 6 个品种马的生长激素基因 1923bp 的片断(GenBank 登录号:AY837571),包括全部外显子和内含子。测序后,对其序列结构、核苷酸组成及所编码的氨基酸进行了初步研究,同时对各品种马 GH 基因全序列进行了 PCR-SSCP 分析。研究结果表明: 1、马 GH 基因含有 5 个外显子和 4 个内含子,5 个外显子大小分别为:10bp、161bp、117bp、162bp 和 201bp;4 个内含子大小分别为 253bp、213bp、199bp 和 272bp。外显子数目、大小、位置与哺乳类其他物种相比,表现出高度保守性。 2、马 GH 基因序列核苷酸组成富含 GC(60%以上),且外显子 GC 含量(61%)明显高于5′端和3′端的非编码区。编码氨基酸的密码子不同位点GC含量也有显著差异,表现为第一、第三位碱基富含 GC,且第一位碱基的 GC 含量接近于全序列,第三位碱基 GC 含量远高于其它位点,达 84.1%,第二位碱基富含 AT。密码子碱基组成的差异因物种不同而异,具有种属特异性。 3、PCR-SSCP 分析结果表明,在所检测的 5′端侧翼区、第一内含子、第二外显子和第五外显子四个位点中,仅第五外显子检测到多态,该多态位点由 A 和 B 两种等位基因控制。GH 基因第 1719 处一个 T→C 的突变和 1743 处 G→A 的突变,导致等位基因 B变为等位基因 A。除纯血马外,A 基因在各品种中均为优势等位基因,B 基因为纯血马的优势基因。在此多态位点,乌珠穆沁马、乌审马和巴尔虎马处于 Hardy-Weinberg平衡状态,纯血马、三河马和锡尼河马则未达到 Hardy-Weinberg 平衡状态。 本研究首次对几个品种马 GH 基因序列及其多态性进行了初步研究,研究结果对今后合理利用、开发和保护我国马品种的遗传资源具有一定的指导意义。
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