随着利率市场化改革的进行,商业银行面临的市场竞争环境越来越激烈。互联网金融正在逐步争夺商业银行的利润,传统的以利差为主要收入来源的经营模式渐显落后。商业银行要想可持续发展,必须提高其创新能力来增强竞争力。现有的一些研究表明,机构投资者在资金、人才、专业水平等方面优于其他投资者,对商业银行绩效有着很大影响。然而,机构投资者持股是否对银行的创新能力有着促进作用,不同类型的机构投资者对银行创新能力的影响是否存在差别,还需要进一步研究。鉴于这方面研究还较少,本文对此进行了深入分析。这对于提高商业银行创新力和促进机构投资者自身的改善都有着理论价值和实践意义。本文在一些基本理论的指导下,对机构投资者影响商业银行创新力的作用路径进行了分析。并根据机构投资者在持股周期、业绩考核、投资风格方面的差异,将机构投资者划分为长期机构投资者和短期机构投资者。长期机构投资者资金来源较稳定,业绩压力小,投资风格稳健,注重银行长期价值,因而会重视商业银行的创新能力；而短期机构投资者业绩压力很大,投资风格激进,注重短期获利,因而不重视创新能力这类长期因素。提出理论假设后,本文运用16家上市商业银行2008-2013的年度数据对假设进行实证检验,分别检验长期机构投资者持股比例、短期机构投资者持股比例、机构投资者整体持股比例与商业银行创新能力之问的关系。结果表明：长期机构投资者持股比例与商业银行创新能力存在显著正相关关系,长期机构投资者稳健,重视长期价值,对商业银行的创新能力起着积极作用；短期机构投资者持股比例与商业银行创新能力存在显著负相关关系,短期机构投资者存在短视行为,追求短期利益最大化,不利于银行创新能力提高；机构投资者整体持股比例与商业银行创新能力存在负相关关系,机构投资者整体上存在短视行为,不利于商业银行创新能力的提高。最后,本文根据研究结论,提出了促进商业银行创新,引导机构投资者发展的相关对策建议。