水稻重大害虫二化螟线粒体基因组学研究

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二化螟(Chilo suppressalis)是水稻危害最大的几种害虫之一,属于螟蛾科昆虫的一种,又称钻心虫。本文首次报道二化螟的线粒体全基因组序列,比较二化螟线粒体基因组序列与其它鳞翅目昆虫的差异,为进一步研究鳞翅目类昆虫分子系统演化建立了基础。为了测定二化螟线粒体基因组序列,设计了10对适合于二化螟线粒体扩增的引物,采用LA-PCR方法扩增了二化螟线粒体基因组不同片断,克隆后或利用PCR产物测序,把不同片断拼接后获得二化螟的线粒体全基因组序列。   二化螟线粒体基因组全长15465bp,包含了37个基因和1个非编码的AT富含区。37个基因包括13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因。二化螟线粒体基因碱基组成具有明显的A+T的偏向性,A+T含量为79.70%,结果表明线粒体基因组具有很强的从GC向AT的进化选择性。二化螟的13个PCGs中coxl的起始密码为CGA,其他12个基因的起始密码为ATN。除trnSl(AGM)外,二化螟线粒体基因组其余21个tRNA编码基因的二级结构为典型的三叶草型。二化螟的AT富含区被确定位于rrnS和trnM之间,长度为329 bp。   已经测定的22种鳞翅目昆虫线粒体基因组AT含量的平均值为80.46%:22种鳞翅目昆虫线粒体基因组AT富含区的平均长度为426bp,草原毛虫的AT区最短319bp,野蚕的AT富含区最长,达到747bp。22种鳞翅目昆虫线粒体基因组AT富含区中,桑尺蠖的A+T含量最高98.25%,黑纹粉蝶的A+T含量最低89.17%。   基于22种鳞翅目的13个蛋白质编码基因的核苷酸序列及相应的氨基酸序列的ML和BI的4种系统进化树结构类似,夜蛾总科Noctuoidea、螟蛾总科Pyralidae和凤蝶总科Papilionoidea关系较近。二化螟属于螟蛾总科,与小蔗螟、亚洲玉米螟、欧洲玉米螟亲缘关系较近。基于单个基于构建的系统树与基于全部13个蛋白基因的系统树结构明显不同。
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