红树林源链霉菌中厦门霉素及多环稠合大环内酰胺类化合物的结构多样性研究

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红树林来源微生物的次生代谢产物结构丰富、生物活性多样,是新药开发的重要来源。本课题对红树林来源的厦门链霉菌Streptomyces xiamenensis 318产生的苯并吡喃类(benzopyran)化合物厦门霉素和白骨壤链霉菌Streptomyces avicenniae 9-9产生的多环稠合大环内酰胺类化合物(polycyclic tetramate macrolactams,PTMs)的结构多样性展开研究。厦门霉素的生物合成机制明晰,其中最后一步为酰胺合成反应,即厦门霉素B在Xim A作用下加载L-苏氨酸形成厦门霉素A。通过体外生化实验对酰胺合成酶Xim A的酶学特征进行了深入研究,发现其对氨基酸底物的选择具有专一性,依赖于ATP,且经过催化腺苷活化和酰胺合成两步反应。采用计算辅助对蛋白定点突变,与体外酶催化相结合,扩大底物多样性,将氨基酸取代侧链从单一的L-苏氨酸替换为多种氨基酸。基于计算机模拟建立了Xim A蛋白及其与xiamenmycin B-AMP复合物的结构模型。在特定位置对Xim A进行蛋白质工程改造,合理设计了29个Xim A突变体,发现F201活性位点对Xim A的底物选择性至关重要,可以明显扩大酶的底物谱,并成功地合成了15种不同氨基酸(包括11个L型氨基酸和4个D型氨基酸)取代的厦门霉素系列化合物(1-14),增加了该系列活性天然产物的结构多样性,也为后期的抗纤维化构效关系研究奠定了基础。此外,我们通过生物信息学分析,从白骨壤链霉菌9-9的基因组序列中发现编码PTMs类化合物生物合成的基因簇,即avi A-D。通过发酵培养、产物提取、结构鉴定,发现该菌株能够产生PTMs类化合物,鉴定了2个PTMs类化合物,包括ikarugamycin(15)和capsimycin B(16)。并采用UPLC-MS的方法,根据5-6-5环类型PTMs类化合物的二级质谱碎裂规律,对产量比较低的化合物17、18、19的结构进行了初步鉴定,推测化合物17为C-3羟基取代epoxyikarugamycin;化合物18是在capsimycin B侧链上具有双键的结构;化合物19是侧链C-30羟基取代ikarugamycin。红树林来源白骨壤链霉菌9-9具有产生多种5-6-5环类型的PTMs类化合物的能力。
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