现阶段,中国已迈入全面建成小康社会、实现第一个百年奋斗目标之后的新发展阶段,作为开启全面建设社会主义现代化国家新征程、向第二个百年奋斗目标进军的第一个五年,国家比过去任何时候都注重发展科学事业这一版图,科技创新能力已成为一个不可或缺的衡量要素。面对如此形势,国家及各地政府纷纷投入大量的人力财力以支持科学研究的发展,同时也出台了一系列的重大政策以保证其顺利进行。公办科研院所占据着国家科研版图的核心位置,获得的研究经费投入也是逐渐攀升,极大程度地保证了科研工作的顺利且深入的开展,为科研工作注入了一剂强心针。科研经费监管作为科研管理工作中不可或缺的重要内容,贯穿于科研项目的整体过程中,其中最直观的三个时间节点为项目立项前、项目执行中以及项目结题。其监管水平和监管效果直接影响着科研项目成果质量及科研经费使用效益。因此,加强监管力度,建立科学、有效的科研经费监管机制可以提高公办科研院所经费使用效益,可以使科研人员更加投入专注于科学研究的事业中,同时也对提升国家科技实力具有重大深远的意义。本文以科研经费监管为视角,以纵向课题经费为主要研究对象,以委托代理理论、预算管理理论为研究理论依据,采用比较分析法、实证研究法等研究方法,通过对S公办科研院所科研经费监管的实证分析,提出我国公办科研院所科研经费监管这个尚待研究的问题。首先,本文对公办科研院所科研经费监管的现状进行研究,系统性地阐述了科研经费运行模式、科研经费内部管理架构及科研经费外部监督的机构与制度规范等内容。然后,本文通过对S公办科研院所的实证研究,详细阐述了S所的科研经费监管现状,从预算编制、监管体系、监管职能部门协作、监管重视程度、监督效果这五个方面来研究分析其中存在的问题及其背后的原因。随后,本文通过对总结国外科研机构在科研经费监管上的特点,提炼出适用于我国公办科研院所科研经费监管优化的相关经验。最后,结合以上内容,本文提出能进一步提升我国公办科研院所科研经费监管的有效措施。本文企望通过对S公办科研院所科研经费监管的实证研究分析,能对我国其他公办科研院所科研经费监管问题提供探索性的优化建议,提高我国整体公办科研院所科研经费的监管能力和效果,提升科研经费使用效益。本文最后提出进一步提升我国公办科研院所科研经费监管的探索性措施和建议,即完善科研经费预算管理制度、确保预算全面严格执行;建立全方位全过程的科研经费监管机制;强化监管意识、明确部门职责;设立符合科研工作特点的绩效评价系统;优化科研经费监督方式、提升监督效果这五个方面内容。