棉花黄萎病毒素诱导表达的陆地棉cDNA序列的克隆与定位

来源 :中国农业科学院生物技术研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mnjhkiuu
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棉花黄萎病(Cotton Verticillium wilt)是由真菌病原大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)引起的维管束病害,在世界范围内流行,是棉花生产中的主要病害之一,迄今为止,棉花黄萎病尚不能得到有效控制。由于棉花黄萎病是一种土传性病害利用物理化学手段进行黄萎病防治效果甚微,培育抗、耐黄萎病的棉花品种是解决黄萎病危害的最为经济有效的手段,利用基因工程方法培育棉花抗黄萎病品种已成为棉花分子育种的重要途径。因此深入了解棉花黄萎病菌与宿主的相互作用分子基础,克隆棉花在黄萎病菌侵染过程中应激表达基因成为研究热点。 本研究利用棉花黄萎病菌毒素粗提物诱导耐黄萎病陆地棉品种中棉12应激基因的表达,鉴定受黄萎病菌毒素诱导的应激cDNA序列,试图获得棉花黄萎病抗性相关候选基因,为利用基因工程途径育种提供新的基因来源。通过分离毒素诱导棉花幼根24小时后的总RNA,PCR法合成双链cDNA,应用抑制消减杂交获得差异表达的180个克隆。经反Northern Blot筛选出15个受棉花黄萎病菌毒素粗提物诱导应激表达的阳性cDNA克隆,将其命名为Vdrg (Response Gene induced by toxin of Verticillium dahliae)并对其进行序列分析和棉花基因组定位。 本研究对获得的15个cDNA序列分析初步表明:Vdrgl序列长度为501bp,含有NBS-LRR保守序列,为NBS-LRR类型抗病蛋白编码基因;Vdrg2序列长度为1048bp,为丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶类似蛋白编码基因;Vdrg3序列长度为409bp,为Zn依赖型脱氢酶类似蛋白编码基因;Vdrg4序列长度1538 bp,为PTS HPR SER型丝-氨酸苏氨酸蛋白激酶类似蛋白编码基因;Vdrg5序列长度为856bp和Vdrg11序列长度为757bp,均为磷酸果糖激酶类似蛋白编码基因;Vdrg6、Vdrg7和Vdrg15序列长度为599bp、986bp、231 bp,均为蛋白激酶类似蛋白编码基因;Vdrg8和Vdrg9序列长度均为409 bp,为细胞色素氧化还原酶类似蛋白编码基因;Vdrg10序列长度为632bp,为糖基化蛋白类似蛋白编码基因;Vdrg12和Vdrg13序列长度分别为708bp、707 bp,均为水解酶类似蛋白编码基因;Vdrg14序列长度为606bp,为细胞色素C类似蛋白编码基因。 利用PimaS6与Acala Maxxa杂交的四倍体棉花海陆杂交群体对12个Vctrg序列进行了棉花基因组定位。定位结果表明:Vdrg1定位于D02连锁群端点,与标记pAR286E4C和Unig22D03bE6D相距5.6cM;Vdrg2定位于18(D)染色体上和A01连锁群,在18(D)染色体上距离端点166.0cM,与标记Unig06G03aE6R相距0.9cM,在A01连锁群上距离端点141.8cM,与标记Coau2L21aE4D相距0.5cM,与标记Coau2117E4C相距1.1cM;Vdrg3定位于D04连锁群,距离端点69.4cM,与标记A1212*E5C相距0.1 cM,与标记A1682E6C相距0.8cM;Vdrg4定位于23(D)染色体,距离端点38.1cM,与标记GatelBD04cE6R(A01,A05)相距0.9cM,与标记相距4.6cM;Varg5定位于D02连锁群距离端点165.4cM,与标记pAR922E4D相距3.7cM,与标记相距5.2cM;Vdrg6定位于A06连锁群和14(D)染色体,在A06连锁群上距离端点77.7cM,与标记Unig23D03bE3C相距1.0cM,与标记pAR071E3C相距0.7cM,在14(D)染色体上距离端点102.1cM,与标记A1449bE2D相距0.2cM,与标记A1222.09相距3.3cM;Vdrg8与Vdrg9定位于D07连锁群距离端点43.4cM,与标记Gate4CA09cE6C相距0.3cM,与标记pAR078cE3C相距1.6cM;Vdrg10定位于A01连锁群和A02连锁群,在A01连锁群上距离端点56.9cM, 摘 要与标记pAR058E4C十足 0.gCM,与标记pM13aE3C不足 22 CM,在 A02连锁群上距离端点46.7CM与标记PVNC244E3C同一位置,与标记GatCZBF03E4C十足 二.6CM,与标记COauZA22bE3R相距5.4CM;VdrglZ与VdTgl3定位于18(D)染色厥离端点95刀CM,与标记 MSAT172lC相距 0.4cM,与标记 Gate3AH03cE3C +R距 2二cM:Vdral4 f{V于染色体距离端点 37.IcM与标记Gate3BEllbE3D相距 1.4cM,与标记 Unig28E02ESC相距5.3CM。
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