【摘 要】
：
目的肠癌分子分型(consensus molecular subtype,CMS)系统将其分为四种亚型,分别是CMS1、CMS2、CMS3和CMS4,目前临床上仍缺乏有效的分子标志物对肠癌进行分子亚型的识别。本
论文部分内容阅读
目的肠癌分子分型(consensus molecular subtype,CMS)系统将其分为四种亚型,分别是CMS1、CMS2、CMS3和CMS4,目前临床上仍缺乏有效的分子标志物对肠癌进行分子亚型的识别。本研究构建CMS4型肠癌甲基化标志物诊断模型,并探讨相关分子SLAMF6在肠癌中的调控作用。方法在国际公认的肠癌分型算法基础上,对TCGA数据库中246例肠癌样本进行CMS分型,比较CMS4型和CMS1-3型间差异甲基化位点,利用随机森林和LASSO回归分析构建CMS4型肠癌的甲基化位点诊断模型;免疫组化分析相关基因SLAMF6在112例肠癌组织中的表达情况,结合临床资料分析其与临床病理参数的相关性;甲基化特异性PCR(MSP)和亚硫酸氢盐测序(BSP)验证SLAMF6在肠癌组织和细胞中的甲基化状态;细胞学试验分析SLAMF6对肠癌细胞生物学行为的影响;q RT-PCR探讨甲基化调控肠癌免疫微环境。结果通过对CMS4型和CMS1-3型肠癌样本进行差异甲基化位点分析,共发现726个差异甲基化位点,且CMS4型甲基化程度要明显高于CMS1-3型,随后利用随机森林和LASSO回归构建CMS4型肠癌的诊断模型,该模型共包含43个甲基化位点,ROC曲线下面积可达0.9893;诊断模型中免疫相关基因SLAMF6引起我们的注意,免疫组化结果显示SLAMF6在肠癌组织中的表达显著低于癌旁组织(p<0.01),且在III期和IV期肠癌组织中表达显著低于I期和II期(p<0.01);SLAMF6的低表达与肠癌TNM分期、肿瘤浸润深度、淋巴结转移显著相关(p<0.05);MSP和BSP证实SLAMF6在CMS4型肠癌细胞中高甲基化,且在转移性肠癌组织中也呈高甲基化状态;过表达SLAMF6可以抑制肿瘤细胞的增殖和促进凋亡,敲减SLAMF6可以促进肠癌细胞的增殖和抑制凋亡。甲基化酶抑制剂5-AZA(5-Aza-2’-deoxycytidine)刺激肠癌细胞分泌CXCL9和CXCL10驱化因子,从而招募CD8+T细胞的浸润,发挥抗肿瘤效应。结论本研究构建CMS4型肠癌43个甲基化位点的诊断模型,相关基因SLAMF6甲基化可以调控肠癌免疫微环境,为CMS4型肠癌的早期诊断和治疗提供新颖的靶标。
其他文献
建国初期的老工业住区作为由福利制跃迁至商品房时代的重要遗留,现已呈现出建筑形态老化、基础设施匮乏、环境质量下降、邻里关系消散等诸多弊端,成为了基层社会治理的“真空”和亟待改善的城市“亚空间”。基于此,本文以谨慎城市更新为研究视角,提出老工业住区户外公共空间的更新策略,以期为老工业住区赋予更高的服务效能,使弱势居住群体获得可负担的社会服务和高品质的生活环境。本文主要研究内容如下:(1)在梳理国内外谨
远程医疗是智慧医疗发展的重要支柱,已成为社会备受关注的医疗问题。为了更好保障远程医疗患者的精准诊治和医疗数据的安全存储,本文针对基于区块链远程医疗会诊的决策共识模型开展研究。主要研究工作说明如下:针对远程医疗会诊中专家医疗质量水平不均,患者精准诊治难以保证的问题,本文提出一种基于聚类算法的医疗节点筛选机制,利用Mini Batch K-means算法和K-Means++算法构建高质量的诊疗节点集合
石墨烯及碳纳米管具有独特的物理化学特性,有望成为新一代铜基复合材料的增强体,本文采用电磁搅拌-超声处理-化学镀-高能球磨复合方法进行分散,采用真空热压烧结方法制备石墨烯及碳纳米管和石墨烯-碳纳米管混杂/铜基纳米复合材料,对铜基复合材料进行组织表征及性能测试分析,采用相关表征设备、万能拉伸试验机、摩擦磨损试验机及电化学腐蚀工作站对石墨烯、碳纳米管及其混杂添加的铜基复合材料的微观组织,力学性能及腐蚀性
针对极薄煤层滚筒采煤机装煤效率低的问题,研制一种滚筒倾斜布置采煤机,以提高极薄煤层采煤机的装煤效率。以倾斜布置滚筒为研究对象,分别从理论、模拟和试验三方面研究其载荷特性和装煤效率。对倾斜布置滚筒进行运动学分析,给出滚筒倾斜布置截齿切削厚度的算法,参考滚筒常规布置截齿三向载荷理论模型,建立滚筒倾斜布置截齿三向载荷理论模型。以滚筒常规布置装煤效率理论模型为基础,综合考虑滚筒倾斜角度对装煤效率的影响,建
情景记忆是人类独有也是最高级的一种记忆模式,指记住过去某个时间、地点的特定事件,对于人类的正常生活十分重要。双相情感障碍症(Bipolar Disorder,BD)是一种危害极大的精神疾病,BD患者即有狂躁发作又有抑郁发作,很难控制自己的情绪。研究证明BD患者的情景记忆功能存在明显的异常。因此,研究人员一直试图据探索出情景记忆的工作机制以及BD患者情景记忆功能异常的原因。功能磁共振成像(funct
本文基于珠光颜料市场竞争日益激烈和Q珠光颜料公司目前发展中逐步突显出的强而不稳等问题的背景下,希望运用与竞争力研究相关的理论和方法来进行Q珠光颜料公司的竞争力研究,进而帮助该公司找到科学、有效并适合自身发展特点的竞争力提升战略举措。本文以珠光颜料制造公司Q珠光颜料公司为研究对象,首先简单阐述了国内外珠光颜料的发展情况,对公司竞争力相关概念、理论进行阐述、回顾相关研究文献;其次,结合Q珠光颜料公司发
古典诗词的语言向以厚重的蕴意为特色,是教师深度教学与学生个性化学习的突出素材。鉴赏古代文学的动词炼字要领,是品读诗歌独特语言特点为何的必经之路,同时更是建立初中古诗词鉴赏策略的“引路人”。该论文以“初中古诗词动词炼字教学策略——以泸水市Y中学为例”作题,从赏析古诗词字里行间的意蕴入手,分析如何把握诗词动词的炼字,牵丝引线,从赏析语言开始,逐步对诗歌的意象与情境形成一定的了解,从而使学生对诗歌的感悟
自然界众多数据都可以用图的形式表示,例如化学分子结构、社交网络、城市计算、知识图谱等等。随着科技和社会的发展,各个领域的数据量也呈指数级增长,图对于复杂系统的强表现力使之成为众多领域问题建模的优先选择。图的分类一直是图处理领域的一个研究热点,对图进行分类在不同的领域有不同的意义,例如在在社交网络领域,图的分类代表着对用户类别的划分和对社区类别的划分;化学领域,图的分类代表着对分子结构和功能的辨别等
随着国家对白酒质量提出更高更严的要求,白酒生产过程可见杂质的高精度在线检测已经成为当前机器视觉模式识别领域的研究热点之一。在白酒生产灌装过程中,由于酒液过滤不彻底、瓶体清洗不到位等原因,诸如纤维、蚊虫、玻璃渣等杂质的混入是难以彻底避免的。目前,我国绝大多数白酒生产企业仍采用传统的人工肉眼灯检法检测,检测效率低下,也对检测工人的视力健康产生不可逆的损伤。为了解决透明瓶装白酒人工检测成本高,而现有自动
新课程改革提出教学要从教师为中心转向学生为中心,并且明确要求教师要进行角色和身份的转变。但是目前教师培训主要聚焦对教师进行教学法和教学设计的训练,对于教师在具体教学过程中身份建构意识和能力的培养相对不足。有效的教师身份建构往往更容易营造和谐教学氛围、提升教育教学效果。因此,有必要将教师身份建构意识和能力的培养作为教师培训的重要内容加以系统研究。教育教学领域现有身份建构研究大多通过叙事分析进行,关注