小黄鱼作为我国近海重要的经济鱼类之一,自实现全人工育苗养殖以来,各项养殖技术获得长足发展,但由于胚胎孵化率限制了小黄鱼（Larimichthyas polyactis）养殖产业的进一步发展。光谱对鱼类胚胎发育的影响具有物种特异性,为明确光谱对小黄鱼胚胎发育的影响及对生产中的潜在应用价值,本研究完成了在6种光环境:红光（660-670nm）、蓝光（455-465nm）、绿光（515-525nm）、黑暗、全光（400-780nm）和自然光下小黄鱼胚胎的孵化率、孵化速度、免疫水平、节律调控和蛋白组学的比较分析,结果发现:各组间孵化率差异显著,其中红光组孵化率最高（49.56%）,其次为黑暗组（38.66%）、全光组（31.46%）、自然光组（31.25%）、绿光组（30.72%）和蓝光组（29.58%）。各组胚胎从受精后13小时开始出现明显的发育速度差异,其中红光组和黑暗组的孵化最快,其次分别是自然组、绿光组、全光组和蓝光组。感光蛋白黑视蛋白melanopsin及节律调控基因clock在不同组中的表达水平存在显著性差异,其中melanopsin在蓝光组中表达水平最高,而在红光组中最低;与之相反,clock基因在红光组中最高,在蓝光组中最低。胚胎中Ig M的含量水平相较于黑暗条件在有光时更高,并在红光组中含量最高;补体C3在自然光组、绿光组和全光组中的水平较高。TGF-β和IL-1β在不同实验组之间同样存在显著差异,两者均在自然光组中含量最高,前者在黑暗和全光组中的含量高于绿光、蓝光和红光组,后者与之相反。以自然光组为对照,对其他5组51hpf的胚胎中的蛋白组进行了分析。GO和KEGG富集分析发现,各组间的蛋白组组成差异主要体现在t RNA的代谢过程,如t RNA硫代修饰、氨基酰基-t RNA的连接酶活性、t RNA结合等方面;除此之外,在氮化合物生物合成如有机含氮化合物和硫中继系统等方面同样存在差异。具体到各组,蓝光组主要在硫化物、泛素蛋白酶,黑暗组在核糖蛋白,全光组在核糖蛋白与肽酶,红光组在DNA拓扑异构酶、绿光组在类环氧化物水解酶等方面具有显著差异,并且主要定位在细胞核中。综合上述实验,光谱对小黄鱼胚胎的孵化、免疫、节律等方面的调控存在显著差异,其中红光提高了胚胎孵化率,加快了孵化进程,增加了Ig M等免疫因子的转录和翻译水平,促进了节律基因表达,提高了胚胎中转录酶及能量代谢酶水平。