本文提出了新时期水利工程移民专业化管理的分析框架，即通过专业化的体制改革、移民管理相关专业化机制的建立、安置与扶持模式的创新，最终实现提高移民可行能力和自生能力的目标，从而从根本上解决传统体制下移民利益与经济发展之间的矛盾冲突，为发展我国水利事业、建立和谐社会提供机制保障。本文的研究得到如下主要结论：第一，必须更新管理观念，从“以工程为本”真正转变成“以人为本”，形成以建立制衡机制为核心的行业改革理念。必须把建立制衡机制作为移民专业化管理改革的共识，建立水利工程移民管理与主体工程平等的目标基础，将水利工程移民管理放到与工程同等重要的位置。第二，随着市场经济改革的深入，必须实施全过程移民专业化管理体制，建立专业化的监督体系和服务体系，赋予移民行业主管机构对征地和移民安置工作实行全过程管理的职能。第三，必须建立以“制衡”为核心的专业化管理机制，通过内部审查、外部审查和社会监理，形成对移民利益保护的完善的体系。制衡机制的建立有利于移民群体主张自己的权利，使移民可以获得相关机构在政策、信息等方面的支持。第四，必须以提升移民的生产、生活水平为核心，创新移民安置与扶持模式，借助借助市场力量，实施开发性移民。安置区土地承载力要与人口发展相适应，且配套建设生产性基础设施。安置工作必须在移民和安置区居民自愿互利的基础上实施。移民参与是做好开发工作的重要条件，要鼓励移民参与移民安置规划的编制、行动计划确定和审查监督等工作。第五，引入社会监督，强化外部审查是确保移民资金正确使用的关键。