我国综合运输系统的发展极不均衡,东部地区交通运输线网密集、横纵贯通,而西部地区发展较缓,交通网络密度小。交通运输业作为一种能耗量较高的产业,其运输效率亟需得到评价,不能盲目地扩建规模,导致过度的能源消耗却达不到应有的产出,应秉承生态文明的理念,合理地运用运输资源,提高资源利用率,促成交通运输业健康有效的发展格局。影响综合运输系统效率的因素众多,能源作为一种经济发展必不可少的要素应当基于其利用效率对投入量做出一定的限制,从而规避高能耗低增长现象。本文基于西部地区交通运输发展现状,收集各省公路、铁路、航空、水运的运营规模以及交通运输业的能耗值作为投入指标,交通运输业生产总值作为产出指标,利用数据包络分析(DEA)的数学思想构建效率评价模型,对西部地区12个省份的综合运输系统效率做出定量分析,揭示了各省各种运输方式的投入规模冗余以及交通运输业能源投入冗余。并进一步通过西部地区各省换算冗余值的横向比较,将冗余程度较大的投入指标归类划分为主要影响因素和次要影响因素,据此提出资源优化配置的相关建议。在上述研究基础上,提出一种考虑运输规模和能源消耗达到相对有效且满足未来运输需求的预测思路,以西部地区云南省为例,借助灰色系统GM(1,1)、BP神经网络理论构建模型进行未来有效的运输规模和能源投入的预测,利用MATLAB进行有关建模及计算,得到的结果可对未来云南省综合运输系统的发展规模和能源投入提供参考方向。此外,结合基于ARIMA模型的各种运输方式客货周转量和能源消耗量预测结果,进一步分析了云南省综合运输结构和能源消耗可能的发展趋势。最后基于以上数据分析,对云南省综合运输系统的发展规划提出可参考的建议。