2001年美国安然公司破产,2008年美国爆发金融危机,2014年北京利达海洋生物馆有限公司和上海超日太阳能科技股份有限公司等等,被特别处理或者终止上市。当前我国不仅是农业大国而且也是农业弱国,农业企业的发展对我国的经济起到至关重要的作用。目前48家农业企业在沪深A股市场上市,而这些农业上市公司也将面临着巨大的市场变革。无论从国内环境的飞速发展,还是从国际环境的经济动荡,所有的上市公司都将面临巨大的复杂的挑战。除了受国际环境和国内环境的变革影响外,还有其内部原因,如公司治理结构不完善等。本文基于农业这个行业进行研究,分析得出农业上市公司公司治理对财务风险的影响状况,这样可以有助于企业完善公司治理结构,控制企业财务风险,提高企业经营业绩,同时对投资者和管理者都具有现实的指导意义。本文以农业上市公司为样本,选取了我国2011-2015五年48家深沪A股农业上市公司,剔除了有缺失的数据,得到37家农业上市公司,共185个样本。通过选择2015年国资委对央企综合绩效评价指标的四个方面,运用功效系数法对选取的指标进行分析,得出综合功效系数得分来划分农业上市公司的警限区间,我们把综合功效系数得分XS≤ 80,定义为财务风险高,设置财务风险虚拟变量为1;综合功效系数得分80<XS≤ 100,定义为财务风险低,设置财务风险虚拟变量为0。文中选取狭义的公司治理,即股权结构、董事会特征、监事会特征和管理层激励四部分。然后从公司治理的各组成部分,对财务风险的影响进行Logistic实证研究,通过相关性分析和容忍度及方差膨胀因子进行多重共线性检验,最后对回归方程进行了拟合优度检验和Hosmer and Lemeshow检验,具有统计学意义。根据前面的实证分析,发现了农业上市公司股权结构、董事会特征、监事会特征、管理层激励这四个方面对财务风险的影响,即股权集中度、国有控股、两职合一能抑制财务风险;股权制衡度、董事会规模、独立董事比例、监事会规模能增大财务风险;董事会会议次数、监事会会议次数、高管人员持股比例、高管人员薪酬对财务风险没有显著影响。并结合我国农业上市公司当前的状况,提出相关的政策建议,即保持适当的股权集中度和股权制衡度;完善农业上市公司独立的董事制度,设置合适的董事会规模;优化农业上市公司监事会结构,完善监事会制度;设计和完善农业上市公司的管理层激励机制。