中国分离巴泰病毒全基因组序列测定与分析

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巴泰病毒(Batai virus,BATV)是布尼亚病毒科(Bnuyavirus)布尼亚病毒属(Bunyavirus)布尼亚姆韦拉(Bunyamwera)血清组病毒成员之一。该病毒为20世纪50年代首先分离自马来西亚捕获的库蚊标本,随后在欧亚等地区多种蚊虫标本中分离到。在日本牛血清、印度家猪血清和苏丹发热病人血清标本中也分离到该病毒,并证实巴泰病毒感染可引起发热,甚至病毒性脑炎症状。1997-1998年东非发生十余万不明原因发热病例,从病人标本分离到病毒,分子生物学检测结果显示为巴泰病毒与Bunyamwera病毒基因重配(geneticreassortment)形成的新毒株Ngari病毒,引起国际社会极大关注。我国学者于1998年在云南省思茅地区捕获的菲律宾按蚊中分离到一株病毒(YN92-4株),血清学试验证实该病毒与布尼亚病毒属及该属的巴泰病毒免疫腹水均有高滴度反应。随后对其S片段进行序列测定,同源性分析和系统进化分析进一步证实YN92-4株为巴泰病毒。为全面了解我国巴泰病毒分离株分子生物学特征,本研究采用RT-PCR和TAIL-PCR方法,首次对我国分离的巴泰病毒(YN92-4株)基因组全编码区进行序列测定和分析。结果显示,YN92-4株病毒基因组由S、M、L三个片段组成,长度分别为947、4371、6860个核苷酸。其中,S片段基因组编码由234个氨基酸组成核衣壳蛋白和由102个氨基酸组成非结构蛋白,M片段基因组编码由1435个氨基酸组成的前体蛋白,L片段基因组编码由2239个氨基酸组成的RNA聚合酶。与国外其它地区巴泰病毒分离株进行基因组全编码区序列比较发现,YN92-4株与日本牛血清分离株(ON-7/B/01株)S、M片段核苷酸(氨基酸)同源性均最高,分别为97.7%(100%)和95.7%(98%);由于本研究是首次开展巴泰病毒L基因片段核苷酸序列研究,国际基因库尚无可参考的序列信息,本研究比较了我国分离的巴泰病毒与同一血清组代表病毒Bunyamwera病毒的L片段,进行核苷酸和氨基酸序列同源性比较,分别为73.5%和81.6%。系统进化分析显示,YN92-4株基因组与其它巴泰病毒分离株在各自分支下形成独立分支。本研究提示我国分离的巴泰病毒YN92-4株未发生基因重配(如Ngari病毒),病毒基因组与日本牛血清分离株(ON-7/B/01株)亲缘关系密切。本研究得到巴泰病毒YN92-4株三个片段完整编码区序列,是世界上首株完成基因组全编码区序列测定的巴泰病毒,也是布尼亚姆韦拉血清组已登记的24种病毒中第二株有基因组全编码区序列的病毒,对我们研究巴泰病毒或者布尼亚姆韦拉血清组的病毒都有积极意义。
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