家蟋蟀翅二型的分子机理研究

来源 :东北师范大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:HUANGKAO2
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
翅二型是昆虫种内形态分化的常见现象,广泛存在于双翅目、半翅目、鞘翅目以及直翅目等昆虫类群中,主要包括“天生型翅二型”和“落翅型翅二型”两类。翅型分化是昆虫适应环境变化而产生的生存应对策略,这种形态发育可塑性一直是众多昆虫学者关注的焦点,探究昆虫翅型分化的分子生物学机制可为理解昆虫适应性进化提供科学解释。现有研究多集中在飞虱、蚜虫等“天生型翅二型”的少数昆虫种类中,对于直翅目和“落翅型翅二型”昆虫的研究相对较少,尤其是对“落翅型翅二型”分化的分子调控机制尚无明确解释。家蟋蟀(Acheta domesticus Linnaeus 1758)是直翅目蟋蟀科中的常见鸣虫,属于“落翅型翅二型”,性状明显易观察,是研究落翅型昆虫翅二型分化的理想材料。本文利用转录组测序、基因共表达网络分析以及RNA干扰等方法对家蟋蟀翅二型分化的分子调控机理展开研究,结果如下:1.家蟋蟀翅二型属“落翅型翅二型”,且存在落翅规律。家蟋蟀羽化成虫初期,雌雄虫体的前后翅均发育完全,均表现为有后翅的“长翅型”。羽化成虫后群体内部分个体出现后翅脱落现象。在本文研究中的饲养条件下,家蟋蟀成虫后约20天,群体内落翅个体数达到高峰,而成虫36天后不再落翅,雌雄家蟋蟀的落翅规律基本一致,无明显差异。落翅后的个体,与后翅直接相连接的肌肉组织形态无明显变化。2.家蟋蟀八个生命时期的转录组测序结果。以家蟋蟀落翅高峰期为取样时间依据,选择家蟋蟀1龄若虫(时期I),3龄若虫(时期II),5龄若虫(时期III),羽化成虫初期(时期IV),羽化成虫后第10天(时期V)、20天(时期VI)、30天(时期VII)、40天(时期VIII)共八个时期的家蟋蟀样本,完成转录组测序。共获得135.23Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到5.0Gb,Q30碱基百分比在91.35%及以上;De novo组装后共获得141,456条Unigenes,其中长度在1kb以上的Unigenes有18,771条;对Unigenes进行功能注释,包括与NR、Swiss-Prot、KEGG、COG、KOG、GO和Pfam数据库的比对,共获得32,508条Unigenes的注释结果。3.家蟋蟀翅二型分化即落翅高峰期前、中、后三个阶段的差异表达基因分析结果。两两比较家蟋蟀落翅高峰前(时期IV+V)、中(时期VI)、后(时期VII+VIII)三个阶段的差异表达基因(DEGs)。Volcano plot,MA-plot,Heatmap结果显示:在家蟋蟀落翅高峰期时DEGs上调,且表达量越高的基因差异越显著;通过GO,COG,KEGG等数据库对DEGs聚类分析发现,DEGs主要富集在“Amino acid transport and metabolism”、“ribosome,purine metabolism”和“protein processing in endoplasmic reticulum”等通路中,说明这些DEGs主要参与家蟋蟀生长发育过程中的蛋白合成与互作。上述分析结果说明家蟋蟀的落翅型翅二型分化很可能是基因调控的结果。4.利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选调控家蟋蟀翅二型分化即落翅的候选基因。以家蟋蟀8个时期的转录组数据获得的21,922个差异基因为数据集,进行基因的表达模式聚类,获得18个模块(用不同颜色表示,详见4.2.2)。将18个模块与家蟋蟀落翅规律关联分析,筛选出表达模式与家蟋蟀落翅规律正相关系数最高的模块为红色模块。在红色模块内选择表达模式与家蟋蟀落翅规律最为相近的profile 9作为关键profile,并以0.45为阈值筛选出具有功能注释信息的23个基因。利用Cytoscape建立基因共表达网络图,选择MCODE值排名前三的基因作为候选基因,分别为:AdomHSP40(Heat shock protein 40)、AdomCFDP(Craniofacial development protein)、AdomDIS3L(DIS3 Like 3’-5’Exoribonuclease)。此外,profile 9内Nylanderia fulva virus(RNA病毒)在家蟋蟀落翅高峰期的表达量远高于其他基因,推测家蟋蟀可能由于感染该病毒发生落翅现象,因此该基因也被作为候选基因。综上,借助WGCNA的方法,共筛选出四个可能调控家蟋蟀翅二型分化即落翅的候选基因。5.RNAi候选基因后统计落翅率发现:(1)胰岛素受体基因与家蟋蟀翅二型分化即落翅现象无直接调控关系。现有研究表明,胰岛素受体可调控飞虱的翅型分化,本文借助家蟋蟀的转录组数据,筛家蟋蟀中的胰岛素受体(AdomInR:Insulin receptor)作为候选基因之一,经RNA干扰AdomInR后,与野生型组的落翅率相比统计发现,落翅率无显著差异,说明AdomInR不参与调控家蟋蟀的翅二型分化即落翅。本文中家蟋蟀与飞虱翅二型发生的本质存在区别,所以二者翅型分化的分子调控机理可能存在差异。(2)AdomHSP40参与调控家蟋蟀翅二型分化即落翅现象。成功RNA干扰五个候选基因(AdomCFDP、AdomDIS3-L、AdomHSP40、AdomInR和Nylanderia fulva virus),统计注射dsRNA后为期40天内不同处理组家蟋蟀的落翅率,发现仅ds AdomHSP40注射组,与野生型和dsGFP注射组相比,落翅率显著降低;AdomHSP40在家蟋蟀落翅高峰期表达量上调,促进家蟋蟀落翅,而通过RNA干扰AdomHSP40,降低其表达量后,家蟋蟀的落翅率降低,说明AdomHSP40参与调控家蟋蟀翅二型分化即落翅现象。荧光原位杂交(FISH)结果显示AdomHSP40基因在家蟋蟀翅基部有表达,且在落翅高峰期的已落翅家蟋蟀个体中表达量高于落翅高峰期前、后,FISH结果进一步证明了AdomHSP40参与调控家蟋蟀落翅型翅二型分化,并初步对其作用组织进行了定位分析。6.家蟋蟀落翅前后鸣声及生殖器官形态差异比较结果。比较家蟋蟀落翅前后雄虫鸣声发现:落翅前后家蟋蟀鸣声的单脉冲持续时长与单脉冲间隔时间存在显著差异,说明后翅脱落对家蟋蟀前翅的振动发音有显著影响;比较家蟋蟀落翅前后雌雄虫的生殖器官形态,结果显示落翅前后精巢与卵巢形态上均无明显变化,推测落翅对家蟋蟀生殖器官形态无明显影响。综上,本文以“落翅型翅二型”的直翅目昆虫家蟋蟀为研究对象,利用分子生物学和生物信息学等方法研究发现AdomHSP40参与调控家蟋蟀翅二型分化即落翅现象,首次对昆虫落翅的分子机理完成基础研究,可为理解昆虫翅型分化提供科学参考依据。
其他文献
01.智慧矿山一路走来智慧矿山是指采用现代高新技术和全套矿山自动化设备等来提高矿山生产效率和经济效益,通过对生产过程的动态实时监控,将矿山生产维持在最佳状态和最优水平。新型数字化技术能够帮助传统采矿企业在生产供应链、设备管理、工业生产系统、新员工培训等环节实现提升,以优化管理、提升效率、节省成本,从而推动整个行业的持续发展。
期刊
尖锐湿疣、传染性软疣、扁平疣,目前患病率高,冷冻、激光及抗病毒治疗疗效欠佳,尤其尖锐湿疣好发于外阴、肛周等温暖潮湿部位。并有少数病例可转变为鳞状上皮癌。我们用抗病毒药结合外用中药洗患处,具有较好疗效。 一、一般资料:三种病共133例。尖锐湿疣63例,其中男性31例,年龄最大50岁,最小19岁;女性32例,最大42岁,最小20岁。扁平疣40例,男女各
期刊
测土配方施肥是以土壤测试和肥料田间试验为基础,根据作物需肥规律,在施入有机肥料的基础上,提出氮、磷、钾和微量肥料的施入时间、方法和数量。本文介绍了建平县自然、气象条件和果园施肥存在问题、果实的营养特点,阐述了测土配方施肥有关技术等。
课堂是实施素质教育和新课程改革的主阵地。而创建和谐高效的课堂教学就要以教研组建设为突破口。本研究是帮助教师提高教学研究水平的一种切实可行的途径。教研组在校本研究中起着至关重要的作用,它是学校基层的管理实体,是学校的主力军,也是提高教学质量的催化剂。因此,加强教研组建设,充分发挥教研组作用,从而打造出高效课堂。教研组活动应尽可能多地针对学生知识掌握,进行方法与技巧点拨,能力训练与提升,思想引领与激励
蝗虫是昆虫纲Insecta、直翅目Orthoptera、蝗总科Acridoidea昆虫的统称,是一类重要的农牧业害虫。因其分布广泛、食量大、食性广、繁殖能力强、迁移速度快,成群的蝗虫可对农牧业产生巨大危害。蝗虫肠道中栖息着大量的微生物,这些微生物与宿主相互作用,相互影响,形成一种协同进化的关系,在此过程当中,微生物与微生物之间也形成了多种多样的种群结构以及生物学功能。研究蝗虫对纤维素的消化及肠道微
里德堡原子既具有相对较长的寿命,又具有长程的原子间相互作用,因此成为了量子计算和量子模拟最有希望的候选者之一。无论是里德堡阻塞效应,还是里德堡反阻塞效应,都已经在量子信息处理中被广泛研究。在此基础上,非传统里德堡泵浦机制可以提供不同于里德堡阻塞和反阻塞的效应,即处于相同基态的原子保持稳定,处于不同基态的原子共振激发。在本文中,我们主要研究基于里德堡原子的非传统里德堡泵浦机制,结合开放系统的有效动算
反褶积、Q补偿、谱白化、小波变换等方法在提高地震资料分辨率的同时往往会放大噪声,降低地震资料的信噪比。由于地震随机噪声服从高斯分布且其本身并无方向性,因而在Shearlet域可将有效信号与随机噪声分开。通过Shearlet变换将地震信号转换到Shearlet域,对Shearlet域系数进行合理的补偿后,再做Shearlet反变换,可实现对地震资料的提高分辨率处理。结合Shearlet变换的这两个特
古人云:"亲其师,信其道。"让每个学生都感到老师喜欢他,或者说做出喜欢学生的样子,是很有必要的。学生喜欢老师了,才有可能向老师倾吐心事,才会把专注的精神放在老师的课上,才能真正实现师生关系的和谐。相反,师生之间彼此谁也看不惯谁,相互只能生出厌恶,老师会不问青红皂白地训斥学生的所有过失,学生则会视老师为"敌人",给老师贴上"恶人"的标签。如何让学生感觉到老师对他(她)的喜欢,愿意亲近老师呢,我
期刊
随着现代科学信息技术的发展,教育和心理评估的测试逐渐由传统的纸笔考试(paper-and-pencil tests)转变为基于计算机平台的测验(computer-based assessments)。随着计算机化测验的广泛应用,记录并呈现学生在题目上的反应过程的信息变得十分容易。学生在题目上表现的作答信息即反应过程数据,被记录到计算机后台的日志文件中。反应过程数据包括反应时间数据,行为过程数据,以
大规模多重检验的问题产生于许多科学研究领域。例如,在全基因组关联分析(GWAS)中,通常需要进行数以万计的检验以寻找与复杂疾病或性状相关联的单核苷酸多态性(SNPs)。一些其它的例子包括:神经影像数据分析[72]、微阵列数据分析[51,52]、空间数据分析[82]等等。到目前为止,一些多重检验方法已经被广泛地应用于众多科学领域。然而,在大规模多重检验中仍然存在一些棘手的问题需要解决。首先,日益产生