当下中国,农村地区正在经历着治理模式的变化。为确保成功的转型,不同学术背景的问题研究专家从各自的角度来寻求转型的路径。随着我国市场经济的深入发展,农民专业合作组织顺应时代需要,在改革开放中迅速兴起,并以其得天独厚的优势,团结和带动了大批农村的居民,集聚了丰富的资源,创造了巨量的社会财富,不但提高了农户经济收入,推动了经济发展,还在基层的政治建设和社会建设中发挥了积极作用,成为乡村治理新兴主体,正深入地参与到乡村社会的方方面面,影响和改变着乡村治理现状。本文基于公共治理创新的背景下,以农民专业合作组织为研究视角,从乡村治理的历史变迁和实践经验出发,探讨了其在乡村治理中的经济功能、政治功能和社会功能。通过对建水县整体情况和个案的调查,进一步探讨农村专业合作组织影响乡村治理的法律因素、政策因素、治理因素、经济因素、社会因素和自身因素,并在制度完善、组织优化和角色重构方面提出建议,充分发挥农民专业合作组织的角色,从而保证农民专业合作组织作为乡村治理的重要主体和力量,在乡村治理的过程中与乡村治理其他主体协同合作,实现互动效应,为推进乡村善治做出贡献。本文通过调查走访、文献收集和政策分析,探讨农民专业合作组织在乡村治理中的作用体现,针对存在的问题提出政策建议,使其更好的发挥治理作用。