YTHDF3通过m6A甲基化调控乳腺癌细胞生物学行为的机制初探

来源 :贵州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bin52833093
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:本研究旨在对腺苷N6位的甲基化修饰(m6A)中关键阅读器分子YTHDF3(YTH N6-Methyladenosine RNA Binding Protein 3)在乳腺癌迁移侵袭及生长增殖中的恶性作用及m6A甲基化修饰对YTHDF3的影响进行初步探索。方法:(1)生物信息学筛选乳腺癌中关键m6A甲基化调控因子:采用多数据库多算法筛选有效预后分子靶点,通过Lasso(Least absolute shrinkage and selection operator)回归的方式建立预后回归模型,并通过单多因素Cox分析预后模型对临床指标相关性进行探讨其能否作为独立预后指标,随后利用log-Rank分析预后能力,最终得到YTHDF3作为乳腺癌中m6A甲基化修饰靶点进一步研究。(2)YTHDF3在乳腺癌及不同分子亚型乳腺癌细胞中的表达情况:通过实时荧光定量PCR(Realtime fluorescence quantitative PCR,RT-qPCR)及Western blot检测乳腺癌不同分子亚型及正常乳腺上皮细胞中YTHDF3的mRNA及蛋白表达情况。(3)采用 siRNA(Small interfering RNA)对MDA-MB-231、MCF-7两株乳腺癌细胞进行瞬时沉默YTHDF3,划痕实验观察YTHDF3对细胞创面愈合能力的影响。(4)构建YTHDF3稳定沉默、过表达YTHDF3、m6A结构域突变型MDA-MB-231、MCF-7细胞株,包括有稳转无义序列的(sh-NC组)、YTHDF3稳定敲低的shY3-1、shY3-2组,稳转空载质粒的Control组、YTHDF3过表达组(YTHDF3-WT)及m6A结构域突变的YTHDF3-Mut组。通过RT-qPCR或Western blot检测YTHDF3的表达情况,确定敲低、过表达及突变效率。(5)Trans well(小室)实验研究YTHDF3稳定沉默后对MDA-MB-231、MCF-7的迁移侵袭能力的影响,CCK-8(Cell Counting Kit-8)细胞活力测定及细胞克隆形成实验检测YTHDF3对乳腺癌细胞增殖生长的影响,并利用Western blot检测迁移侵袭相关蛋白表达。(6)Trans well实验研究YTHDF3过表达及YTHDF3中m6A结构域突变后对MDA-MB-231、MCF-7迁移侵袭能力的影响,CCK-8实验测定及细胞克隆形成实验检测YTHDF3的m6A结构域对乳腺癌细胞增殖生长的影响,并利用Western blot检测迁移侵袭相关蛋白表达。结果:(1)生物信息学筛选m6A甲基化调控因子共计17个,单因素Cox分析筛选共4个靶点分子(RBM15B、METTL16、YTHDF3和IGF2BP1),并成功利用Lasso回归算法建立预后模型,多数据库比对分析后确定YTHDF3作为研究乳腺癌中m6A甲基化修饰的靶点分子。(2)组织化学染色确定YTHDF3在乳腺癌组织中较癌旁组织高表达,在乳腺癌不同亚型细胞系中除HER2+亚型外,均较乳腺正常上皮细胞表达升高。(3)成功构建YTHDF3稳定敲低、过表达及m6A结构域突变的MDA-MB-231、MCF-7细胞株,并构建无义序列及空载细胞系作为对照组。(4)瞬时沉默YTHDF3后,MDA-MB-231、MCF-7细胞系较瞬转无义序列的对照组创面愈合能力明显下降(P<0.001),稳定沉默YTHDF3后MDA-MB-231、MCF-7(shY3-1、shY3-2)较稳转无义序列的对照组(sh-NC)迁移侵袭及增殖生长能力下降(P<0.05),其迁移侵袭标志分子MMP-2、MMP-9蛋白表达明显下降(P<0.05)。(5)YTHDF3过表达(YTHDF3-WT)与稳定转染空载质粒的对照组(Control)相比迁移侵袭,增殖生长能力明显增强(P<0.05)。但是与m6A结构域突变细胞株(YTHDF3-Mut)相比迁移侵袭,增殖生长能力无差异(P>0.05)。结论:(1)YTHDF3可以作为乳腺癌中m6A甲基化研究的有效切入点,具有良好的预后诊疗能力及分子靶点潜力。(2)YTHDF3作为恶性靶点影响乳腺癌细胞的迁移侵袭,增殖生长的恶性细胞功能学进程。(3)m6A甲基化在YTHDF3发挥主要功能,影响乳腺癌细胞的恶性生物功能学。
其他文献
正渗透是一种浓度驱动的新型膜分离技术,它相比于传统膜分离技术具有能耗低、膜污染小、水回收率高等优势,因而被广泛应用于水处理、能源生产、食品加工、医疗等领域。由于正渗透面临膜污染、反向盐通量和浓差极化问题,造成了水通量及产水品质下降,所以正渗透仍存在应用瓶颈。膜污染、反向盐通量及浓差极化与水分子和离子在正渗透膜内复杂的输运过程有关,因此研究正渗透膜纳米通道内水分子和离子的输运机理可为正渗透的进一步发
学位
随着移动通信和互联网技术的飞速发展,智能终端中出现了更加多样的计算密集型和延迟敏感型的服务,如人脸识别、增强现实和虚拟现实等。这些服务具有计算复杂度高、耗能高及时延敏感等特点,它们在增加网络负载的同时也给移动终端(Mobile Terminal,MT)设备的计算能力及续航能力带来巨大的挑战。为应对这些挑战,装备移动边缘计算(Mobile Edge Computing,MEC)的超密集网络应运而生。
学位
水是生命发展的必需品,我国的水资源分布不均,所以水资源的人均占有量要低于世界的平均水平。因此研究我国农村饮用水水源地的安全监管,有利于保护农村水资源,帮助社会经济的可持续发展,尤其是塑造高质量的农村区域经济,进而推进乡村振兴战略的全面实施。通过对烟台市蓬莱区农村的实地调研以及查阅文献资料,沿着“提出问题、分析问题和解决问题”的思路,分析当前烟台市蓬莱区农村饮用水水源地的现状,挖掘存在的问题及原因,
学位
随着高速铁路的大量发展和运营速度的不断提高,越来越多的病害也随之产生,其中路桥过渡段的不均匀变形问题尤为突出。目前在高速铁路路桥过渡段方面的研究主要集中在不均匀沉降,而对不均匀膨胀和不均匀沉降均有发生及其处理办法方面的研究相对较少。为保障列车的高速、安全运行,开展高铁路桥过渡段不均匀变形方面的研究有着极其重要的意义。以沪昆高速铁路K442+730-K442+830为研究对象,基于国内外文献以及现场
学位
<正>“装置突然出现晃电怎么办?第一步,内操要立即关闭进料阀,打开返回裂解阀门,给整个系统泄压。第二步……”6月5日17时,中国石化齐鲁石化塑料厂高压聚乙烯车间主控室内,一场针对装置晃电、停电点桌面应急演练正在紧张有序进行。“车间利用副班学习及碎片化时间开展应急技能培训已成为常态。”高压聚乙烯车间主任朱国庆说,现在是“天天有培训,班班有应急”。
期刊
青蒿素是从药用植物黄花蒿Artemisia annua中分离的一种倍半萜内酯,广泛应用于疟疾治疗,野生资源含量较低。为缓解持续增加的需求,尝试提高青蒿素含量或产量的研究成为热点课题。转录因子具有调节代谢途径中一个或多个基因表达的作用,据报道,已有多个转录因子家族参与调节青蒿素的生物合成和积累,干预转录因子表达是提高青蒿素含量或产量的重要手段。从转录因子调控黄花蒿腺毛形成与发育和转录因子调控青蒿素生
期刊
随着各大城市地铁线网逐年加密及列车载客量和运行速度逐渐加快,地铁运营所诱发的环境振动问题也愈发严重。目前,地铁振动问题已成为我国进一步深入发展城市轨道交通的一项关键制约因素。然而,地铁振动又是一个涉及列车、轨道、隧道、土体及地面建筑物的跨专业、跨学科、跨领域的超大耦合系统动力学问题,想要完整且全面对该过程进行精准的预测分析是一项十分艰巨且耗时的任务,而且一旦振源的振动传入土体中,那么环境振动将几乎
学位
<正>文章从坚定忠诚意识、大局意识、责任意识、奉献意识和廉洁意识五个方面阐述如何做好办公室工作,更好地贯彻"五个坚持"。办公室作为一个单位承上启下的枢纽、领导决策的参谋、推动工作的助手、服务机关的后勤,地位和作用非常重要。2014年5月8日,在同中办干部代表座谈时,明确要求办公厅工作要做到"五个坚持",即坚持绝对忠诚的政治品格、坚持高度自觉的大局意识、坚持极端负责的工作作风、坚持无怨无悔的奉献精神
期刊
随着人们在既有建筑中停留时间的不断增长,对室内生活环境的舒适度及空气品质的要求也在不断提高,空调作为调节室内温湿度及空气品质的主要设备,在我国建筑中被广泛运用,由此带来的是不可忽视的高建筑能耗问题。具体表现为,由空调通风管道阻力所引起的风机能耗占建筑能耗的15%—30%左右,这一数据仍在接连上涨。空调风管中数目较多的局部构件是造成其大阻力的主要原因,在空调通风管道中由局部构件弯头、三通等所造成的阻
学位
本文以2022年高考物理广东卷实验试题为例,探索基于“学习进阶”的试题分析与教学策略。发现“学习进阶层级”与“科学探究水平”的对应关系:经验层级对应水平1;映射层级对应水平2;关联层级对应水平3;系统层级对应水平4;整合层级对应水平5。提出基于“学习进阶”的教学策略:用“一量多材”突破映射层级试题;用“一理多用”突破关联层级试题;用“以点为面”突破系统层级试题;用“以法为心”突破整合层级试题。
期刊