【摘 要】
:
随着生物基因相关技术的发展,基因组测序的完成预示着人类步入了后基因组时代,生物基因的研究方向也从基因序列研究转向了结构和功能的研究。深入挖掘其中的信息,为生命科学
论文部分内容阅读
随着生物基因相关技术的发展,基因组测序的完成预示着人类步入了后基因组时代,生物基因的研究方向也从基因序列研究转向了结构和功能的研究。深入挖掘其中的信息,为生命科学提供更多更有价值的知识,为揭示生命奥秘提供相关理论基础。基因调控网络的构建,其目的在于从基因表达数据推断出基因之间彼此作用的潜在关系。本文针对当前构建基因调控网络方法中存在的缺点,提出两种用于构建基因调控网络的改进算法,提高预测的准确度,本文的主要工作如下:为了解决K2算法难以准确确定初始节点顺序以及容易陷入局部最优解等问题,本文提出基于K2算法和模拟退火算法的贝叶斯网络构建算法MI_K2SA。MI_K2SA算法利用互信息衡量节点之间的关联程度构建出无向网络,依据最大权生成图获取初始的节点顺序作为算法MI_K2SA的初始输入,在搜索最佳网络过程中融合模拟退火算法跳出局部最优网络从而搜索全局最优网络,通过在Asia网络上和酵母菌数据集上的实验表明,MI_K2SA算法不仅可以有效地获得初始节点顺序,提升算法性能,而且获得的网络具有更高的准确率。针对用于构建基因调控网络的基因数据存在大变量小样本以及没有充分利用基因数据时序性等问题,提出基于最大信息系数构建时序基因调控网络算法MICRAT。最大信息系数可以衡量两个基因关联程度,而且即使在少量数据集上也可以得到较高的精确率,适合具有高维少样本的基因数据。算法MICRAT引入最大信息系数衡量两个基因之间的关联程度,以此构建基因调控网络无向图,使用条件互信息去除无向图中冗余的三角环,考虑到基因数据时序性特点,综合利用时序互信息和条件相对平均熵进行无向图中边的定向。通过在仿真数据集和真实数据集上的实验结果表明,该算法即使在时序样本个数很少的情况下依然具有较高的准确度。
其他文献
钢铁交易属于大宗交易买卖,在现实生活中大多采用人工操作的方式,在信息化高度发的今天已略显陈旧,虽然人工操作可以做到很灵活,但面对大量的数据与信息,人们很难做到百密无
时下自然的人机交互技术(HCI)研究异常活跃,各种新颖的人机交互技术不断涌现。基于视觉的手势交互由于其自然、直观和非接触式交互等特点,近二十年来一直是备受关注的研究热
指纹识别技术是生物特征识别技术中的一种,指纹的唯一性和稳定性使其有其他手段无法比拟的优越性。随着科技的进步和社会的发展,采集仪和芯片性价比不断提高,指纹识别算法的
随着虚拟仪器软件LabVIEW的出现,数据流编程方式渐渐地改变了传统文本语言编程的方式,图形化编程逐步扩大着编程语言开发的市场领域,另一方面,当前的指纹识别系统逐渐向着小型化
随着射频技术的发展,RFID被广泛的应用于物流、零售等众多领域。RFID系统中,多个标签同时回复阅读器时会发生碰撞。为了减少碰撞,提高标签识别效率出现了两类防碰撞算法,一类是基
目前互联网上每天爆发着海量的信息,搜索引擎成了我们查找信息的最重要的工具。然而搜索引擎所提供的信息检索服务大多数仍然是大众化的,这种综合性搜索引擎往往不能满足特定用
我国公路的发展一日千里。道路质量的及时检测在延长道路使用寿命的同时,也可以避免路面病害给行车安全方面带来的隐患。考虑到人工检测方法存在效率低、精度低、危险系数较
无线Ad Hoc网络(Wireless Ad Hoc Networks)是没有中心实体和基础设施支持的自组织网络,它由多个带有无线收发装置的移动节点组成。移动终端具有路由转发功能,可以通过无线链
红外热成像技术是利用自然景物的热辐射得到成像数据,形成视觉图像,可以在夜间甚至全黑的环境中工作,而且由于红外辐射具有穿透烟雾的能力,使得红外热成像技术具有很长好的穿
VPN是从专用网络发展而来的,它利用公共网络建立私密传输通道,提供安全地端到端的数据通信。其中PPTP是第二层隧道协议,并且已经集成到Windows操作系统中,具有安全性高、成本