随着人力资本作用的提高、技术创新能力的增强，“股东至上”理论在实践中面临的挑战日益加剧，学术界一直致力于完善多元利益主体共同参与公司治理的方式，希望能够彻底解决公司治理问题。 本文在总结、分析公司治理理论的基础上，以MAS理论为指导对公司内部治理机制进行了系统性研究。首先将股东会、董事会、监事会、经理层、债权人和员工界定为公司内部治理主体，并对这些主体的属性进行了分析，通过公司内部治理系统概念模型来描述主体之间的逻辑关系，然后对公司内部治理机制进行分析，从替代与协同角度解释了公司内部治理机制间的互动关系，采用基于主体的建模方法构建了公司内部治理机制互动模型，即公司内部治理系统是一个由多种治理主体积极参与、各种治理机制互动的过程，强调各种治理机制协调均衡、共同作用是系统有效运行的重要保证。最后，从系统仿真的角度，运用多主体仿真平台Swarm软件对公司内部治理机制间的互动关系以及互动模型的运行进行仿真研究，对所建立的模型进行抽象模拟，分析结果用以验证公司内部治理机制互动模型提高公司治理效率的结论，期望能为我国公司治理实践提供借鉴，同时也拓宽了Swarm软件的应用领域。