水稻全基因组拷贝数变异研究揭示复制基因的非对称进化

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 1次 | 上传用户:tianyibian
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基因的拷贝数变异作为一种常见的基因组变异类型,是基因演化的一种重要推动力,也影响着基因的表达丰度。植物中已发现多例拷贝数变异与重要的农艺性状相关联,暗示着基因拷贝数变异可能是作物育种研究的新方向。目前,有关基因拷贝数变异对表达的影响及其演化规律的系统描述,在植物中还不多见。本研究首先基于93份水稻核心种质资源的高深度重测序数据,开发了一个检测高可信度拷贝数变异位点的综合流程和严格的筛选条件,为水稻功能基因组学研究提供了可靠的方法学参考和拷贝数变异数据。结合各个样品的转录组数据,揭示了基因表达水平与拷
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株型是决定作物产量的关键因素,是主要作物选择和驯化的重要驱动力。在水稻和小麦等作物中,紧凑和半矮化的株型、短而粗的节间结构极大地提高了作物的收获指数和产量。研究植物的株型特性对于培育高产品种,满足世界上日益增长的口粮需求至关重要。在本研究中,我们通过EMS(甲烷磺酸乙酯)诱变鉴定了水稻矮化多分蘖突变体hd103,用图位克隆的方法获得了影响该表型的基因OsIAA16,该基因编码一个AUX/IAA家族
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油菜角果在收获时段易裂会造成严重的产量损失。油菜角果易裂与角果离区细胞降解密切相关。一些基因,诸如BnJAG,BnSHP,BnIND和BnALC都参与到角果离区形成及发育中。为了提高油菜抗裂角性,利用CRISPR/Cas9系统将BnJAG,BnSHP,BnIND和BnALC分别进行敲除。对油菜中BnJAG所有拷贝进行敲除后,角果的大小及侧生组织发育受到很大影响。整个角果成“愈伤”状,没有明显的果瓣
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