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近年来，无机金属离子的检测在医药，食品和环境领域的应用越来越受到人们的关注。有机分子药物的分析检测也一直是分析科研工作者的重点。毛细管电泳是八十年代新发展起来的测定分离技术。它具有高效，快速，进样量少，操作简单，自动化程度高等特点。自20世纪90年代以来一直是人们研究的热点,现已广泛应用于医药学、分子生物学、石油化工、环静等领域。本论文选择金属阳离子的毛细电泳分析和药物分子的毛细电泳分析为研究对象，得到以下数据和结论。1、建立了以咪唑-乙醇酸为流动相对Na+、Li+、Mg2+、Ca2+4种无机阳离子检测的方法，检测限分别是0.01mg/L、0.01mg/L、0.01mg/L、0.02mg/L。建立了以咪唑-乙醇酸-18-冠-6醚为流动相同时检测K+,Na+,Li+,Mg2+,Ca2+,NH+46种离子的方法，检测限分别是0.015mg/L、0.012mg/L、0.01mg/L、0.01mg/L、0.02mg/L、0.1mg/L。干扰实验法发现Cd2+、Cr3+、Ni2+、Pb2+、Zn2+、Cu2+、Fe3+、Hg2+等对测定无干扰。方法显著性检验发现NH+4的测定，新方法和传统方法纳氏试剂之间不存在显著性差异；Ca2+、Mg2+的测定，新方法和传统方法络合滴定之间不存在显著性差异，说明新方法可以代替传统方法，节约了分析时间，经济环保，避免了了剧毒试剂HgCl2的使用。2、建立了咪唑-乙醇酸体系分析一些常见的过渡金属和重金属Cd2+、Cr3+、 Ni2+、Pb2+、Zn2+等5种阳离子线性范围、检测限、RSD和回收率均良好。且常见环境水中的K+,Na+,Li+,Mg2+,Ca2+,NH+4等对实验结果无干扰。3、合成了巯基苯并咪唑这种新型背景电解质并运用其分析汞离子。发现汞离子在此体系下线性范围、检测限以及RSD均良好。且不受铁、铜等常见离子的干扰。4、建立了高效毛细电泳法来测定吡罗昔康含量。方法采用毛细管电泳仪进行实验：弹性石英毛细管柱75μm60cm，进样压力10mbar，电动进样5s，分离电压24kV，毛细管温度20℃，检测波长为254nm，运行缓冲液为0.01mol/L硼砂溶液。采用t法和F法进行与HPLC法的显著性检验。5、对苯并咪唑为背景电解质进行阳离子分析的前期工作：合成和紫外波谱特性进行了实验，得到了有利于后期CE实验的数据；建立了万古霉素的HPLC分析方法并进行了评价，有利于后期的CE工作。