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水体富营养化是目前国内外水体所面临的重大环境问题之一。以恢复沉水植物为主的生态工程技术是当前解决水体富营养化的关键技术之一。沉水植物可以通过多种方式减轻水体富营养化程度，抑制藻类水华的爆发。本文从野外原位调研与室内微宇宙实验两方面入手，系统的研究了野外原位及微宇宙实验系统两种条件下沉水植物对浮游植物群落结构的影响，主要结论如下: 1.国家水专项“十一五”西湖课题2010年至2012年期间在基本没有沉水植物的西湖湖西的茅家埠、乌龟潭和浴鹄湾等区域成功恢复了以穗花狐尾藻(Myriophyllum spicatum)、五刺金鱼藻(Ceratophyllum demersum)和苦草(Vallisneriaspiralis)为主的沉水植物群落。通过原位实验调研，研究了沉水植物恢复前后浮游植物群落结构的变化，结果表明:与恢复沉水植物之前的2009年9月相比，2012年8月时茅家埠浮游植物密度下降了74.61％，达到2.35×106ind./L，Shannon-Wiener指数H增加了9.17％，达到2.01;乌龟潭浮游植物密度下降了83.7％，达到1.03×106ind./L，H增加了41.64％，达到2.24;浴鹄湾浮游植物密度下降了93.24％，达到4.57×105ind./L，H增加了144.1％，达到2.36。沉水植物的大量生长或衰败对于TN、TP产生一定影响;2009年至2012年夏季三个湖区中浮游植物密度与TP、NO3--N、NH4+-N、TN、SRP、BOD5、CODMn、TSS均不相关（P＞0.05）。 2.在微宇宙实验中，通过控制光照和营养盐浓度等条件分别研究了在湖西区域成功恢复的苦草、五刺金鱼藻和穗花狐尾藻三种沉水植物的化感作用对采集于杭州西湖湖西湿地的藻类密度、叶绿素a浓度、群落结构、多样性指数等的影响。其结果表明，三种沉水植物对微宇宙系统中的藻类都具有明显影响，藻类密度与叶绿素a浓度受到显著抑制。三个草-藻研究系统中藻类群落结构都发生了变化。在实验末期苦草组、金鱼藻组和穗花狐尾藻组中藻类细胞密度分别较初始值降低了37.06％、78.37％和83.40％，达到1.27×106ind./L、5.11×105ind./L和5.15×105ind./L而空白组中藻类细胞密度增加了8425.90％，达到2.14×108ind./L。实验过程中，空白组中的浮游植物优势属由蓝藻门的平裂藻属(Merismopedia)转变为绿藻门的盘星藻属(Pediastrum)和十字藻属（Crucigenia）;苦草组中的优势属由绿藻门的栅藻属（Scenedesmus）转变为绿藻门的绿球藻属（Chlorococcum）和团藻属（Volvox）;金鱼藻组中优势属由栅藻属（Scenedesmus）转变为小球藻属(Chlorella)和盘星藻属（Pediastrum）;穗花狐尾藻组中的优势属由绿藻门的栅藻属（Scenedesmus）和月牙藻属（Selenastrum）转变为绿藻门的绿球藻属（Chlorococcum）。栅藻对三种沉水植物的化感作用敏感性较弱。藻类生物多样性方面，穗花狐尾藻系统中最高，其次是金鱼藻组，最后是苦草组，其Shannon-Wiener指数H分别为2.76、2.06和0.72，穗花狐尾藻组中H的显著高于苦草组（P＜0.05）。