本研究首先设计了针对HBV、HCV、HEV保守区基因序列的六对引物,经反复试验建立用于HBV DNA及HCV和HEV RNA检测的特异敏感免疫捕获多联RT-PCR方法,此方法与临床应用的检测试剂盒对比,具有操作简便、敏感、特异等优点,检测敏感性可达10病毒粒子/ul。利用此方法检测到5株猪HEV;通过对5株的序列分析,从分子水平探讨与猪源HEV和与国内其他不同来源HEV的关系,探明其基因型归属,以及变异程度。对HEV的Ch-S-1株进行了全序列测定,分析了该毒株的系统进化与及基因组结构,证明Ch-S-1为基因IV型。Ch-S-1株全基因组除去3’端poly(A)尾,其长度为7147nt。5’非编码区为25bp,3’非编码区为94nt;5’和3’非编码区之间有3个ORF;ORF1从26到5146位核苷酸,全长5121nt,编码1706aa;ORF2从5143到7167位,全长2025nt,编码674aa;ORF3从5171到5515nt,全长345nt,编码114aa。在上述研究基础上构建了pIRES-SFV-HEV体外转录载体。