基于CHA反应的肿瘤来源小细胞外囊泡检测策略研究

来源 :重庆大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhihong0223
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近年来,液体活检因其微创取样广受临床研究关注,其样本来源于循环系统,可以规避组织活检取样的局部限制性,更容易获得全面的“诊断信息”。作为液体活检的重要标志物,肿瘤来源sEVs(cancer-derived sEVs,csEVs)在肿瘤发展进程中具有介导免疫刺激和免疫抑制的功能,灵敏检测生物样本中csEVs并分析其相对丰度对肿瘤发展进程的追踪评估具有重要意义。然而,实现复杂临床样本中csEVs的识别和鉴定仍存在一定的挑战。一方面,csEVs粒径小、丰度低,难以实现特异性捕获;另一方面,细胞来源的异质性以及分离手段带来的异质性可能掩盖csEVs在肿瘤发生发展中的真实作用,造成误诊。基于物理特性的定量方式以及传统生化分析手段难以满足现行临床实践中对于高精度分析肿瘤来源sEVs的迫切需求。因此,发展一种新型的精准、灵敏的肿瘤来源sEVs检测手段既是临床研究的目的,也是亟待解决的科学问题。凭借着优异的信号放大能力以及一定的环境耐受性,催化发夹组装反应(catalytic hairpin assembly,CHA)已经在分子诊断领域取得了突破性研究进展,同时也为csEVs的量化技术研究带来了良好的发展契机。基于sEVs相关研究,本文以乳腺癌细胞MCF-7来源的csEVs和乳腺上皮细胞MCF-10A来源的sEVs为模型,联合功能化磁珠富集和CHA信号放大技术,有效实现对血浆样本中csEVs灵敏检测并进一步分析其相对丰度,以期揭示csEVs与肿瘤发生发展的关系。主要研究内容与结果如下:(1)具有识别功能的催化发夹组装体系的构建。为解决常规生化分析技术灵敏度低的问题,引入CHA作为核心元件,围绕其循环检测的特点设计和构建相关体系。CHA具有高灵敏、无酶参与、对环境依赖性低、可实现指数级信号扩增等优势,已被广泛应用于新型生物传感器的开发。本实验以sEVs膜表面标志性CD63蛋白和肿瘤特异性EpCAM蛋白为检测靶标,使用核酸适配体序列搭载催化发夹组装反应的引发链,构建具有识别功能的适配体-引发链,通过NUPACK软件进行结构模拟,发现增加引发链序列不会对适配体特殊结构产生影响。同时,CHA信号放大元件展示出稳定的茎环结构,为该反应低背景提供保证。利用凝胶电泳实验及荧光检测手段验证功能化CHA体系信号放大效果,设置相互干扰实验证明两组独立的CHA反应程序可以在同一体系下相互协作。以上结果表明,具有识别功能的催化发夹组装体系的构建成功。(2)基于催化发夹组装反应的csEVs检测策略研究。为了攻克csEVs检测以及分离问题,本课题以功能化CD9磁珠为富集单元,csEVs标志性CD63蛋白和肿瘤特异性EpCAM蛋白为靶标元素,结合具有识别功能的CHA信号放大元件,实现了临床样本中csEVs的灵敏检测,且最低检测限为420 particles/μL。同时引入csEVs相对丰度指标,一定程度上规避了临床样本提取得到的sEVs总量差异,进一步验证csEVs相对丰度指标与乳腺癌患者病理分期之间的潜在关联,结果表明疾病严重程度与病人血浆中csEVs相对丰度呈正相关,后续将扩大临床样本进一步验证这一相关性。综上,为解决csEVs粒径小、丰度低的问题,本论文提出了一种新型csEVs检测策略,利用核酸适配体赋予CHA反应体系独立识别EpCAM信号和CD63信号的能力,便于同一检测样本中EpCAM和CD63信号的读取,可有效实现对细胞系来源和临床血浆样本来源的csEVs灵敏检测,并引入csEVs相对丰度指标,发现其与乳腺癌患者病理分期之间存在一定关联,为揭露csEVs在肿瘤发展进程中的真实作用奠定基础。
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