【摘 要】
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在该研究中,用分子动力学(MD)对此双螺旋在水溶液中进行了六个没有限制的50ps长的模拟,其中,三个的初始结构为标准的B-DNA,另三个的初始结构为标准的A-DNA,模拟温度分别为16K
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在该研究中,用分子动力学(MD)对此双螺旋在水溶液中进行了六个没有限制的50ps长的模拟,其中,三个的初始结构为标准的B-DNA,另三个的初始结构为标准的A-DNA,模拟温度分别为16K、293K、300K.该文分析了模拟后这六个模型的构象角、相邻磷酸间的距离、碱基对上两个磷酸间的距离以及能量,并把300K下,标准B型DNA为初始结构的模拟结果与实验数据作了比较.结果如下:无论初始结构为A型或B型,模拟后基本上都有一定的偏离,但还是在原有的初始结构范围内,偏离不是很大;改变模拟的温度对结构影响不大,但对能量影响很大;模拟的结构数据与实验数据基本吻合.
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