基于GWAS的lncRNA遗传变异与HBV感染结局的关联研究

来源 :广东药科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:cw545400
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:分析基于GWAS的lnc-ACACA-1和lnc-RP11-150O12.3.1-1遗传变异对HBV感染结局影响的单独作用及基因-环境交互作用。方法:基于乙肝相关肝癌的全基因组关联研究(genome-wide association study,GWAS)文献,提取与乙肝相关肝癌有显著关联的SNP(single nucleotide polymorphism),根据SNP间的连锁不平衡确定研究区域,在这些区域查找有潜在功能的lncRNA SNP,最终筛选出2个lncRNA(lnc-ACACA-1和lnc-RP11-150O12.3.1-1)上的7个SNP(rs7221955、rs9891142、rs11776545、rs2275959、rs2298320、rs2298321、rs1008547)。以554例HBV自限清除、552例慢性乙肝患者(chronic hepatitis B patients,CHB)和644例乙肝相关肝癌患者(hepatocellular carcinoma,HCC)为研究对象,采用病例对照研究,应用多分类logistic回归模型与多因子降维法相结合的策略,系统分析单位点、基因-环境交互作用对HBV感染结局的影响。结果:1.在环境因素分析中,吸烟、饮酒、肿瘤家族史均是HBV慢性感染及HBV相关肝癌发病的危险因素(吸烟,OR=7.67,95%CI=5.82-10.12;饮酒,OR=6.24,95%CI=0.19-0.32;肿瘤家族史,OR=4.63,95%CI=3.20-6.73)。2.以HBV自限清除组为对照,CHB组为病例,发现rs7221955和rs9891142与年龄有相乘和相加的交互作用,且年龄大于60岁的个体携带rs7221955 C等位基因或rs9891142 C等位基因可以增加HBV慢性感染的风险(rs7221955,OR=1.84,95%CI=1.06-3.21;rs9891142,OR=1.78,95%CI=1.03-3.10)。3.以HBV自限清除组为对照,HCC组为病例,发现rs7221955与年龄有相加的交互作用,且年龄大于60岁的个体携带rs7221955 C等位基因或rs9891142 C等位基因可以增加HBV相关肝癌的发病风险(rs7221955,OR=1.82,95%CI=1.05-3.16;rs9891142,OR=1.80,95%CI=1.04-3.10),同时携带CC单体型也可增加HBV相关肝癌的发病风险(OR=1.32,95%CI=1.02-1.70)。4.以CHB组为对照,HCC组为病例,发现rs11776545、rs2275959、rs1008547与肿瘤家族史有相乘和相加的交互作用,且有饮酒的个体携带三个位点的突变等位基因可以降低HBV相关肝癌的发病风险(rs11776545,OR=0.61,95%CI=0.38-0.96;rs2275959,OR=0.60,95%CI=0.38-0.94;rs2275959,OR=0.63,95%CI=0.40-0.99)。5.以HBV自限清除组为对照,CHB/HCC组为病例,发现rs7221955和rs9891142与年龄有相乘的交互作用,且年龄大于60岁的个体携带rs7221955 C等位基因或rs9891142 C等位基因可以增加HBV慢性感染的风险(rs7221955,OR=1.82,95%CI=1.12-2.96;rs9891142,OR=1.78,95%CI=1.10-2.89)。结论:1.吸烟、饮酒及肿瘤家族史可以增加HBV慢性感染及HBV相关肝癌发病的风险。2.在年龄大于60岁的个体中,携带lnc-ACACA-1上的rs7221955 C或rs9891142C等位基因可以增加HBV慢性感染及HBV相关肝癌发病的风险,且携带CC单体型可以增加HBV相关肝癌发病的风险。3.在饮酒者中,携带lnc-RP11-150O12.3.1-1上的rs11776545 A、rs227595A及rs1008547 A等位基因可以降低HBV相关肝癌的发病风险。
其他文献
猪胸膜肺炎是南胸膜肺炎放线杆菌(App)引起的一种急性传染病;猪肺疫是南多杀性巴氏杆菌(PM)引起的一种危害严重的疾病App和PM都是引起猪呼吸道综合征的主要细菌性病原,临床上混合感
服装理论家李当岐教授曾提出,进入20世纪后,在工业化的进程下,流行不再局限于小规模的模仿现象,而朝着跨越地域、国界、阶层的局限,大规模、快速度地加速发展。此话揭示了时
半夏连作障碍引起的药材产量低、品质差,药农种植积极性不高,临床用药安全无保障等问题日益突出,严重制约了中药材半夏产业的可持续发展。研究发现轮作和间作能在不同程度上
田径被称为"运动之母",在学校体育学科教学中,田径教学位于重要地位。激励是一种教学艺术,将激励方法用到田径教学中去,可以唤醒学生的进取精神,鼓舞学生不断进步。所以,许多
2004年8月4日,银监会批复同意上汽通用汽车金融有限责任公司开业。这意味着,该公司成为我国第一家获准开业的汽车金融公司。在中国汽车市场增速放缓、库存压力加大的情况下,汽车
意大利于1946年以全民公决的方式选择并确立了共和政体,1948年共和国宪法正式生效,由此奠定了意大利现行国家制度的基本框架。依据宪法规定,意大利国家机构由总统、内阁、议会、宪法
2014年12月29日我国第一家纯互联网银行正式开业运营,互联网银行不设物理营业网点,其业务全在线上运营。互联网银行创新的经营模式和运营思维打破了传统银行经营时间和空间的
目的:乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)标志物阳性的患(携带)者,在细胞毒性药物化疗后或接受免疫抑制剂治疗后由于免疫功能状态改变,导致HBV再活跃复制,引起肝功能受损,
分别以银光、双依2个丝瓜品种和黑籽南瓜,与苦瓜碧秀进行嫁接试验。试验结果表明,3种砧木嫁接成活率均达到90%以上,但以银光为砧木最好,成活率、产量最高,嫁接愈合时间短,为
目的探讨肝胆手术胆瘘的外科治疗临床效果。方法随机选取2013年1月至2015年1月期间在汝阳县人民医院接受治疗的40例肝胆手术胆瘘患者,对其临床资料进行回顾性分析。结果 27例