近年来，随着抗生素、皮质类固醇激素和免疫抑制剂的广泛应用，肿瘤放疗、器官移植、导管技术的发展及HIV感染的增多，导致真菌感染的发病率和死亡率不断上升，已经引起临床医生的高度重视。抗真菌药物的研究逐渐成为热点，如何选择合适的药物，指定合理的治疗方案，在最安全、最经济的条件下获得最佳治疗具有重要的意义。 目前药物疗效诊断主要是由医务人员对真菌组织切片或者对培植在载玻片上的真菌组织在显微镜下进行形态学观察，并依据经验得出诊断结论。这种方式定性的成分居多，客观性不足，在诊断科学逐步走向量化的道路上，有必要使用计算机信息处理技术推动病理诊断的自动化和科学化。 本文针对上述问题，用计算机图像处理及模式识别等信息技术对显微真菌图像的自动处理和定量分析的方法进行了研究，并针对医学图像分析中的难点(例如：显微切片图像背景复杂，分割困难)，提出了双阈值分割方法。经过大量的试验证实这是一种可靠、准确、稳定的分割方法。根据本系统所处理的真菌图像的特点，对此分割方法中所要用到的的高通滤波算法进行了改进，为本系统的实现提供了客观的依据。 本文给出了解决真菌显微图像的自动化检测的技术途径和实现方法，并且对大量的图像进行了分析和处理，得到了主治医师和医院专家组的认可，为进一步的研究打下了基础。