鹅5种常见病毒多重PCR检测方法的建立及和田地区某鹅场小鹅瘟病毒VP基因分析

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小鹅瘟病毒(Gosling plague virus,GPV)、新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)、鹅星状病毒(Goose Astrovirus,GAst V)、呼肠孤病毒(Avian reovirus,ARV)、坦布苏病毒(Tembusu virus,TMUV)是分别引起小鹅瘟、新城疫、鹅痛风、鹅出血性坏死性肝炎、鹅产蛋下降综合征的病原。上述5种病毒可经卵垂直传播,在引入种蛋时,有携带病原的风险。雏鹅感染致死率高,造成巨大的经济损失,严重威胁鹅产业的发展。为能够检测新疆地区鹅上述5种病毒,本研究拟建立GPV、NDV、GAst V、ARV、TMUV多重PCR检测方法。参照Gen Bank中GPV、TMUV、GAst V、ARV和NDV基因序列,针对保守区域分别设计特异性引物,构建阳性质粒,建立5种病毒单项PCR检测方法;以单项PCR方法为基础,优化多重PCR反应条件,分析其灵敏性、特异性和重复性,并对临床样品进行检测。结果表明,建立的多重PCR检测方法退火温度、引物浓度分别在56~58℃、0.8~1.2μm/L间效果最佳,与禽流感病毒、禽痘病毒、鸡传染性支气管炎病毒无交叉反应,GPV、TMUV、GAst V、ARV和NDV的检测下限分别为:8.6×10 copies/μL、4.4×10~3 copies/μL、8.3×10~3 copies/μL、3.3×10~3 copies/μL以及8.8×10~3 copies/μL,且重复性较好。和田地区某鹅场临床样品GPV、GAst V和NDV的阳性检出率分别为74.29%(26/35)、2.86%(1/35)、20.00%(7/35),其余未检出;另外,GPV和NDV混合感染检出率为14.29%(5/35)。利用建立的多重PCR方法检测和田地区某鹅场肝组织样品,将处理后的单纯感染组织液接种鸭胚,盲传三代;设计GPV结构蛋白(VP)基因特异性引物,收集尿囊液并进行PCR扩增,构建克隆载体,分析VP1、VP2、VP3基因核苷酸相似性及亲缘关系,并预测VP蛋白高级结构。PCR结果显示,从鸭胚尿囊液中检测到GPV,将其命名为GPV/Goose/XJHT/2020。该毒株对鸭胚有致病性。VP基因序列分析结果表明,该毒株与强毒株DY16、RC16相似性99%以上,亲缘性高且处在同一分支;其与疫苗株(SYG61v)弱毒株GPV 98E相似性为95%,亲缘性较低且处在不同分支。VP蛋白二级结构预测结果显示,其具有较好免疫原性。综上所述,本研究建立了灵敏性高、特异性强、重复性好的GPV、TMUV、GAst V、ARV和NDV多重PCR检测方法,应用其从和田地区某鹅场检测出GPV感染,并进行了病毒VP基因遗传进化分析。本研究为新疆地区鹅场上述5种鹅病毒病的快速、简便检测、诊断提供了方法,并为揭示新疆地区鹅场GPV的流行规律提供实验数据。
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