清代宁古塔副都统衙门是清政府设置于中国东北，管理其辖区驻防八旗的机构，具有军政合一的特点。清统治者根据当地政治局势的变化、经济社会的发展状况，在宁古塔将军衙门下，先后设立了7个副都统衙门，宁古塔副都统衙门就是其中具有重要作用的衙门之一。清代宁古塔副都统衙门的设置、移驻和撤销，鲜明体现了清代东北边疆军事局势、政治、外交、经济等出现的新情况、新变化及清代统治者为维护其对东北的有效统治、抵御沙俄入侵，在宁古塔地区进行的军事部署和战略防御。自顺治皇帝始设至康熙朝根据形势进行调整，宁古塔副都统衙门在抵御外敌入侵、开发边疆、发展经济，巩固统治方面起到了举足轻重的作用。清代宁古塔副都统衙门研究作为清代东北地方政权史研究的重要组成部分，对了解清代宁古塔地区各种要素具有重要的意义。