针对SR市农村合作金融机构的改革发展，本文梳理了该市农村合作金融机构发展历程，对包括农行脱钩（1996年-2003年）和统一法人社（2003年至今）两个主要经历的改革阶段及近年来发展改革、升级达标、提高经营能力水平的情况作出简要记载和分析论述；通过运用经验总结法、个案研究法和观察法等研究方法，归纳总结了SR市农合机构在改革发展中存在的要点难点，分析了改革的得失，引申性地提出了国内部分经营水平低下的农村合作机构进一步深化改革必须解决的若干要点，包括了法人治理、产权制度改革、资产质量和损失准备以及案件防范四大方面十六个主要问题，对问题产生的原因及影响进行了研究。本文选取SR市农村合作金融机构部分成功克服困难之过程做了举例论证，提炼出较好的经验成果和方式方法，并针对提出的四大方面十六个问题逐一给出了操作性较强的对策与建议。