本文以皖南仙寓山和浙北临安桐坑村的南方红豆杉种群为研究对象，分别于2007年和2008年10～12月，研究了动物与南方红豆杉种群更新的关系以及两个种群的天然更新格局。得到：1、两地的种子扩散动态。仙寓山种群种子扩散期是34d，种子因自然落果、鸟类取食和人为采果而消失。桐坑村种群种子扩散期是44d，种子因自然落果和动物取食而消失。种子扩散前后的种子库中被嗑食的种子都占了最大比例；枯枝落叶层中的种子多于土壤层；种子库数量变化较大的集中在中上坡。2、两地的动物活动与南方红豆杉天然更新。仙寓山和桐坑村种群共6种主要鸟类的取食活动对种子天然更新产生重要作用。桐坑村种群有4种啮齿类在中上坡活动，是典型的种子捕食者，对种子的破坏率是74.44％。桐坑村种群有2种蚂蚁具种子扩散作用。推测果子狸对南方红豆杉天然更新有作用。3、两地天然更新种群特征。仙寓山种群中30cm以下的幼苗占总数80％以上。存活曲线为Deevy-Ⅲ型；空间分布格局呈聚集分布。1年生幼体死亡率极高；种群动态显示种群在缓慢增长。桐坑村种群中30cm以下的幼苗数量占总数的39.61％。存活曲线属于Deevy II和Ⅲ型之间；空间分布格局呈聚集分布。种群显示成年个体数量稳定，呈稳定增长趋势。