M6A相关调节因子在头颈鳞癌中的临床意义

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目的:N6腺苷甲基化(m6A)是RNA上的一类普遍性修饰,在癌症的发生发展中起着至关重要的作用。这种修饰是动态可逆的,主要由三种类型的m6A相关调节因子调控(甲基化转移酶、去甲基化酶、RNA结合蛋白)。迄今,这些m6A相关调节因子在头颈鳞癌的功能与角色仍不明晰,具有广阔的研究空间。本文旨在探讨m6A相关调节因子在头颈鳞癌中的角色及功能,并识别出其中最关键的预后相关的m6A相关调节因子进行进一步研究。方法:我们利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库的头颈鳞癌数据及汕头大学医学院附属肿瘤医院收集的头颈鳞癌数据(n=40)探索了19个不同的m6A相关调节因子在头颈鳞癌中的临床意义,并结合生信在线分析网站以产出真实可靠的分析结果(Oncomine,UALCAN,Kaplan-Meier plotter,HPA,c Bio Portal,Linked Omics,String)。结果:我们发现m6A相关调节子的转录组表达水平在头颈鳞癌组织中整体上呈现高表达趋势,差异具有统计学意义。RNA结合蛋白IGF2BP2可能作为其中核心的m6A相关调节子。它的m RNA及蛋白水平在头颈鳞癌组织中升高,差异具有统计学意义。通过多因素回归分析及人类蛋白图谱HPA结果,其被认定为头颈鳞癌预后不良的独立风险因素。在临床病理联系中,IGF2BP2在人乳头瘤病毒感染阴性(HPV)的头颈鳞癌患者的表达比阳性患者高,差异具有统计学意义。在基因变异分析中,有32%的头颈鳞癌患者存在IGF2BP2变异,变异的主要类型是基因扩增与m RNA高表达,并且存在这种变异的头颈鳞癌患者整体有着更差的预后。而在功能分析中,IGF2BP2表达可能与头颈鳞癌的免疫浸润负相关,特别是CD8+T细胞的浸润负相关。最后,在蛋白互作分析中,HMGA2可能与IGF2BP2在头颈鳞癌相互作用。结论:RNA结合蛋白IGF2BP2可能可以作为头颈鳞癌中的核心m6A相关调节因子,其在头颈鳞癌中活性较高,且为预后不良的独立风险因素。M6A RNA结合蛋白IGF2BP2可能为未来头颈鳞癌治疗的新方向,值得进一步机制研究。
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