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本研究利用微卫星标记技术对我国的五指山小型猪、滇南小耳猪、贵州小型香猪及其近交系、南宁巴马香猪近交系、荣昌猪、沂蒙黑猪、汉中黑猪、二花脸猪、金华猪等10地方猪品种DNA水平上的遗传多态性进行了研究,探讨了它们之间的亲缘关系、群体内的遗传变异。并首次利用微卫星标记分析估计了8个地方猪品种及2个近交群体的近交系数。结果如下: 1.10个地方猪品种间的遗传变异分析 1.1 本研究所选用的10个微卫星位点,除S0003位点在7个群体中表现为单态,Sw790为中度多态位点外,其它的8个位点均为高度多态位点。在10个微卫星位点上共检测到了153个等位基因,其中Sw769最多为23个,S0003位点最少为5个,平均每个位点的等位基因数为15.3个。IGF-1位点的197bp、Sw769的148bp可作为巴马香猪区别于其它群体的特征性条带;S0005位点的281bp、285bp可作为荣昌猪和滇南小耳猪的特征性条带。 1.2 Hardy-Weinberg检验表明:在Sw781位点上,除巴马香猪表现为单态(x1值等于0)外,其余群体都处于遗传不平衡状态;IGF-1位点上,滇南小耳猪、二花脸猪、金华猪和沂蒙黑猪处于平衡状态,其它均处于遗传不平衡状态。 1.3 10个群体的平均位点杂合度在0.4561~0.6446之间;平均多态信息含量亦较高,在0.4241~0.6184之间,平均有效等位基因数在0.2495~3.7573之间,这表明中国地方猪种的遗传多样性比较高。 1.4 根据Nei氏标准遗传距离绘制了NJ和UPGMA两种聚类图。NJ聚类结果将本研究10个群体分为3个类群:贵州小型香猪及其近交系、滇南小耳猪和五指山小型猪为一个类群;沂蒙黑猪、汉中黑猪和荣昌猪为一个类群;二花脸猪、金华猪和巴马香猪为一个类群。而UPGMA聚类结果则将这10个猪种分为4个类群:贵州小型香猪及其近交系、五指山小型猪、二花脸猪和滇南小耳猪为一类群;汉中黑猪、沂蒙黑猪和荣昌猪为一类群;金华猪和巴马香猪各为一个类群。根据Cavalli—Sforza和Edwards余弦距离所得的NJ聚类结果将这10个群体分为4个类群:贵州小型香猪及其近交系和荣昌猪为一个类群;二花脸猪、金华猪和巴马香猪为一类群;沂蒙黑猪和汉中黑猪为一类群;五指山小型猪与滇南小耳猪为一类群。而UPGMA聚类结果则将这10个猪种进一步划分为5个类群:五指山小型猪、沂蒙黑猪、贵州小型香猪及其近交系、荣昌猪和二花脸猪为一个大的类群;汉中黑猪、滇南小耳猪、金华猪和巴马香猪各为一个独立的类群。通过对2种遗传距离所得的4个聚类结果的比较分析发现:运用Net氏标准遗传距离所得的NJ聚类结果比其它的分类方法更为准确。由Net氏标准遗传距离而来的NJ聚类结果中,除巴马香猪外,其它的地方猪品种与它们的地理分布以及根据生产性能、外型特征及血液蛋白所得而来的分类结果基本一致。巴马香猪的分类结果与地理分布的差异,可能是由于它的近交培育造成的。2.10个地方猪种的群体近交分析ZI 随机交配群体的近交系数都比较低,贵州小型香猪的最高,为0.1992,荣昌猪的最低,为0刀727。小型猪群体内的近交程度较其它5个地方猪种的高,但F检验表明:各个品种间近交系数的差异不显著卜0刀5人2,2贵州小型香猪近交系和巴马香猪近交系的近交系数分别为0.5907和0.4761,这表明两近交系的近交程度较高。