结球甘蓝遗传图谱的构建及主要农艺性状的QTL定位

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xieqinghang
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结球甘蓝简称甘蓝(Brassica oleracea var.capitata)起源于地中海至北海沿岸,是国内外普遍种植的一种重要蔬菜。构建一张高密度的永久分子遗传图谱不仅是分子标记辅助育种、QTL精确定位的基础,也是基因图位克隆的关键,具有重要的理论意义和实际应用价值。本研究利用不同生态型的结球甘蓝栽培品种的高代纯合自交系624和24-5杂交获得F1代,再通过游离小孢子培养获得102个DH株系(D19),以此DH系群体为试材,利用AFLP分子标记构建甘蓝分子遗传图谱并进行主要农艺性状的QTL定位。主要研究结果如下:(1)对甘蓝6种基因型的F1代进行游离小孢子培养,结果有3种基因型的出胚率较高,其余的3种基因型却很难获得小孢子胚,说明胚状体的发生存在基因型间的差异。最终从624和24-5杂交获得的F1代中,通过游离小孢子培养构建了包含102个株系的DH系群体D19。(2)利用双亲对AFLP引物进行筛选,从512对AFLP引物组合中筛选出多态性较好的引物组合87对,用这87对引物组合对DH系群体进行分子检测,产生多态性标记771个,平均8.9个/引物组合,其中来源于亲本624的标记有408个,占总标记数的52.9%,来源于亲本24-5的标记有363个,占总标记数的47.1%,符合1:1的分离比。另外,AFLP标记也出现了高比例的偏分离,偏分离标记有459个,占AFLP标记总数的59.5%,偏分离的标记中偏向亲本624的标记为165个,偏向亲本24-5的标记为294个,各占总偏分离标记数的35.9%和64.1%,表明该DH群体的偏分离偏向于父本24-5的基因型。(3)运用JoinMap3.0软件对771个多态性标记进行分析,获得了一张由8个连锁群组成,包括458个标记,覆盖基因组655cM的甘蓝AFLP分子连锁图谱,平均图距为1.23 cM。连锁群长度在30cM~15lcM之间,连锁群标记数为5个~165个,平均图距为0.92cM~6cM。连锁群中包含263个偏分离标记,所占比例为57.4%。统计偏分离标记在连锁群中的分布,发现LG1、LG4和LG7绝大部分或将近一半标记都为偏分离的标记,表明这些染色体区段有可能存在偏分离热点区域。该图谱是目前第一张利用结球甘蓝品种间杂交获得的DH群体构建的分子遗传图谱。(4)应用软件Map QTL4.0和多QTL模型法对甘蓝25个主要农艺性状进行QTL定位和遗传效应分析,共检测到了11个与主要农艺性状相关的QTL,分布于6个连锁群上。其中控制开展度、最大外叶长、外叶形状、株型、最大外叶柄长和外叶叶脉这6个与叶片相关的性状的QTL各1个,其贡献率分别为10.3%、9.9%、9.8%、9.3%、8.7%和8.6%;控制叶球形状、叶球质地、外短缩茎长、叶球内颜色和叶球高这5个与叶球相关的性状的QTL各1个,其贡献率分别为11.9%、8.8%、9.2%、9.9%和8.4%。
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