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2010版《中国药典》药材和饮片鉴别项下主要包含经验鉴别、显微鉴别、理化鉴别。目前,中药材DNA条形码分子鉴定指导原则已获准纳入2010版《中国药典》(增补本),本研究依照该指导原则对《中国药典》收载中药材进行DNA条形码分子鉴定。本文以羌活、枸杞子和红景天三种药材为例,基于ITS2序列探讨中药材DNA条形码分子鉴定法在实际鉴定工作中的操作流程及实际应用价值,得出以下结论：(1)以65份羌活药材及其混伪品为研究对象,依照中药材DNA条形码分子鉴定法标准操作流程获取其ITS/ITS2序列。结果显示羌活药材ITS序列长度为603-604bp,ITS2序列长度均为228bp,羌活药材ITS/ITS2序列单倍型与其基原植物叶片序列一致。基原物种羌活(Notopterygium incisum)和宽叶羌活(N. franchetii) ITS/ITS2序列种内平均Kimura2-Parameter(K2P)遗传距离均远远小于其与混伪品的种间平均K2P遗传距离；NJ树结果显示羌活、宽叶羌活与其混伪品均可明显区分。ITS/ITS2序列作为DNA条形码能稳定、准确鉴别羌活药材及其混伪品。(2)枸杞子药材及其混伪品共计77份实验样本均能够稳定获得ITS2序列,宁夏枸杞(Lycium barbarum)、枸杞(L. chinense)和黑果枸杞(L. ruthencium)三个物种ITS2序列比对前长度分别为230bp、212-229bp、229bp。基于ITS2序列构建的系统发育NJ树以及比对法(BLAST1)和最小距离法(Nearest distance)均能够明显区分上述三个物种。ITS2序列能够作为枸杞子药材及其混伪品鉴定的DNA条形码。(3)基于红景天属10种植物共82份实验样本ITS2序列构建大花红景天(Rhodiola crenulata)及其同属近缘物种DNA条形码数据库。应用该数据库对100份购白药店及医院的红景天饮片进行鉴定,90%的红景天饮片能够获得可用于分析的条形码序列,比对结果显示仅有40%的供试样本ITS2序列与大花红景天相似度最高,38.9%与齿叶红景天(R. serrata)相似度最高,余者为红景天属其他物种。本研究表明市售红景天饮片基原物种来源复杂,应用中药材DNA条形码分子鉴定法能够对中药材流通市场进行有效监控。综上所述,中药材DNA条形码分子鉴定法能够实现对《中国药典》收载中药材羌活、枸杞子和红景天及相应混伪品的有效鉴定,为其他重要中药材DNA条形码分子鉴定研究提供示范,有利于规范药材市场,为保障临床用药安全奠定基础。