制造业在我国经济社会发展中具有重要的地位,其自主创新能力对于提升我国的国际竞争力具有重要意义。近年来,外商直接投资(FDI)大量地涌入我国制造业。大量事实表明:FDI的流入促进了我国制造业的技术进步和产业结构升级,确实在一定程度上促进了我国制造业的发展。众多学者纷纷研究了FDI对我国企业自主创新能力的影响,但是尚未得出一致结论。而且流入到我国制造业的FDI在来源地、技术水平以及行业流向等方面存在差异,那么FDI对我国制造业内资企业自主创新能力的影响是否也存在差异?本文在阐述FDI影响我国企业自主创新能力机制的基础上,分别从来源地和技术水平来界定异质性FDI,通过选取2009-2014年我国制造业27个行业的面板数据,在借鉴道格拉斯生产函数的基础上建立计量经济模型,实证分析了异质性FDI对制造业内资企业的自主创新能力有何种影响,然后又分别采用2009-2011、2012-2014年的数据从时间角度考察了这种影响的变化,然后结合相关理论全面分析了实证结果产生的原因,并提出相关的政策建议。本文得出以下结论:(1)总体FDI对制造业内资企业自主创新能力的提升产生了明显的正向促进作用,但近年来促进作用明显减弱。(2)按来源地不同,港澳台来源FDI对制造业内资企业的自主创新能力的提升产生了明显的正向促进作用,但近年来促进作用明显减弱了,其减弱程度高于总体FDI对自主创新能力正向促进作用的减弱程度;其他来源FDI整体上对制造业内资企业的自主创新能力未产生明显作用,虽然近年来其正向作用开始明显,但是其正向促进作用的绝对值也有所下降。(3)从不同技术水平来看,中等技术水平FDI对我国制造业内资企业的自主创新能力的正向促进作用最大最显著,高等技术水平FDI虽然也产生了明显的正向促进作用,但其作用程度要远远小于中等技术水平FDI,低技术水平FDI的正向促进作用具有明显的滞后性;近年来,高、中、低三种技术水平的FDI所发挥的正向作用都明显减弱,其中低技术水平FDI的正向促进作用减弱的最明显,由显著正向促进作用变为显著负向抑制作用。