对蛋白质折叠到自然结构的研究多年来一直是国际上的一热门课题.近年来,由于实验技术的提高和理论模型的进一步的完善,一些新的物理观点被提出,如用折叠斗和能量地形的物理图象来研究蛋白质的折叠过程.根据这样的理论,研究人员基于一个简单的非格子模型,通过Monte Carlo方法对蛋白质折叠的模拟,研究了两种类型的相互作用能的能量涨落对蛋白质折叠的影响:(1)不随时间变化的能量涨落和(2)随时间变化的能量涨落对蛋白质折叠的影响.这两种能量涨落的情形所描述的都是能级分布不均匀的能谱,模拟显示前者不利于折叠而后者则有利于折叠.对此研究人员做了一个分析讨论,得到的结论很好的解释了模拟的结果.研究人员的模拟还得到了折叠时间和蛋白质链长之间的标度关系和适宜快速折叠的温区.研究人员另外一个工作是在简单立方格了模型中进行的Montte Carlo模拟,得到了类似非格子模型中的折叠时间和温度的关系.在格子模型中对27单体链通过穷举紧密结构(3*3*3立方结构)研究了序列和能量阻挫对蛋白质稳定性的影响,发现折叠态能量低的氨基酸序列和较小的阻挫使得蛋白质更稳定.