西方人群中蛋白质酪氨酸激酶JAK2V617F突变体与邻近SNPs之间相关性的分析及JAK2V617F检测新方法的建立

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费城染色体阴性骨髓增生性肿瘤(Ph-MPNs)是一组临床症状各异的慢性血液病,它以髓系造血细胞的无限增殖为显著特点。MPNs多发于平均年龄55岁以上的中老年人群,大多数MPNs患者体内存在蛋白质酪氨酸激酶JAK2的激活性突变体-JAK2V617F。但是,一个单独的点突变如何能够引起临床症状不同的3种MPNs亚型仍然是人们研究的焦点。研究发现,单倍型(Haplotype)46/1(或称“GGCC”),是JAK2V617F突变阳性MPNs发生的危险因素。我们通过应用高效而准确的Nested-AS-PCR方法对962例来自于西方人群的DNA样本进行了JAK2及其3个相邻SNPs的基因型检测,并利用分析软件SNPStats对数据进行了相关性分析。结果发现,SNP rs56241661的5bp缺失等位基因、rs10974944的G等位基因和rs12343867的C等位基因是JAK2V617F发生的危险因素;上述危险性等位基因组成的单倍型是JAK2V617F的危险性单倍型。这些数据在为我们以后深入研究JAK2V617F致病机理及筛选选择性JAK2V617F抑制剂等方面奠定了基础。对JAK2V617F的早期检测是临床预防、诊断和治疗MPNs疾病的关键基础。但是,到目前为止,尚无一种高度灵敏且准确可靠的方法能够应用于JAK2V617F的早期检测和MPNs疾病的早期预防。为此我们开发了一种结合限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)、巢式PCR(Nested-PCR)和等位基因特异性PCR(AS-PCR)的方法—RFN-AS-PCR法用于JAK2V617F的检测。我们分别以JAK2V617F突变比例已知的质粒DNA和人血细胞DNA为标准品来考察该方法的灵敏度。结果表明,该方法对样品中JAK2V617F的检测灵敏度高达0.001%。我们采用该方法,在105例血细胞计数正常的健康人基因组DNA中发现了3例为JAK2V617F突变阳性,而这3例在使用灵敏度较低的方法检测时未被发现。这种能够在早期发现JAK2V617F的新检测方法,对于MPNs及相关疾病的早期诊断和预防具有深远意义。
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