当今世界,全球性科技革命蓬勃发展,高新技术成果向现实生产力的转化速度加快,高新技术越来越成为经济社会发展的决定性力量,成为国家综合国力得以形成和发挥的重要基础和关键。科技企业孵化器作为连接知识创新源头和高新技术产业的桥梁,作为培育自主创新企业和企业家的平台,已成为提高科技自主创新能力的关键环节,成为创新成果产业化的重要载体,成为国家科技创新体系的重要组成部分。在我国科技企业孵化器起步于20世纪80年代。经过二十年的发展,我国的孵化器事业取得了巨大的成就。但与此同时,我国的孵化器事业发展仍还存在一些有待解决的问题。论文针对我国科技企业孵化器发展过程中存在的问题,从系统的角度探讨了孵化器运行的影响因素、运行机制和经营绩效等问题,其研究成果对从整体规模上推动我国孵化器事业的发展,提高科技企业孵化器的孵化质量与水平,促进我国高新技术企业的健康发展具有重要的理论价值和现实意义。论文应用企业创业理论、孵化器理论、区位优势理论和产业群等理论,采用定性和定量分析相结合的方法对我国科技企业孵化器的系统运行机制和经营绩效问题进行了深入研究。论文在国内外相关研究的基础上,通过调查、研究,获取大量第一手数据,并据此从多个角度对我国科技企业孵化器的发展状况和运行结构进行了深入细致分析,总结和提炼了我国科技企业孵化器运行发展中存在的主要问题。论文对科技企业孵化器运行的影响因素进行了分析,包括孵化器的内部条件因素、外部环境因素和关联因素,在此基础上构建了孵化器的运行系统：内部系统和外部环境系统,并对孵化器的系统结构进行了探讨。论文重点讨论了科技企业孵化器的三种运行机制：企业入孵筛选机制、孵化培育机制和毕业退出机制。在孵化器的孵化培育机制分析过程中,论文通过构建博弈分析模型探讨了孵化器内的企业集聚效应和企业间技术溢出的外部效应问题。论文构建了科技企业孵化器绩效评价的指标体系和评价模型。在指标体系的设计过程中,论文从系统的角度出发,本着过程评价和结果评价相结合的基本原则确立了由15个指标组成的科技企业孵化器绩效评价的指标体系；在评价模型的选择上,论文通过对孵化器各种绩效评价方法的比较分析,确立了基于主成分分析方法的科技企业孵化器绩效评价模型。为使论文的研究更具实际意义,论文还选择了我国在孵企业超过200家的16家孵化器为样本,对他们的绩效进行了综合评价。论文最后结合我国科技企业孵化器发展的实际情况,有针对性地提出了提升我国科技企业孵化器运行绩效、促进我国科技企业孵化器事业发展的对策建议。