MYLK4、MTPN基因多态性及其与不同品种绵羊生长性状的关联分析

来源 :西北民族大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:biiq123
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
绵羊是世界上重要的经济动物之一,为了提高绵羊的生产效率,鉴定与生长性状相关的分子标记一直是畜牧育种工作者的重要工作之一。传统育种需要长时间的观察和试验,分子标记育种技术可以快速地筛选和精确地评估、选择绵羊遗传物质中的具有潜力的优异基因型,从而提高畜产品的产量和质量,绵羊遗传质量和优良性状的稳定性,进而提高绵羊产业的经济效益。MYLK4(Myosin Light Chain Kinase 4,肌球蛋白轻链激酶)是一种激酶,在肌肉的收缩中发挥重要作用,与动物的生长性状密切相关。研究表明,MYLK4参与了肌肉收缩、细胞增殖和分化,是肌肉发育过程中重要的调控因子。MTPN(Myotrophin,肌侵蛋白)基因编码的蛋白质是一种结合蛋白,参与并维护了肌肉的发育。相关研究表明,MTPN基因编码的蛋白质可能通过与Myo D蛋白相互作用,在调控动物肌肉细胞的增殖、分化和重塑细胞外基质等多个方面产生了重要的影响。本研究通过对两个候选基因编码的氨基酸理化性质、跨膜结构域等进行生信分析,对可能影响绵羊主要生长性状的SNP进行挖掘,并在共计1557个成年绵羊个体中通过PCRSSCP结合一代测序技术进行了实验验证,以期为绵羊的分子标记育种提供参考。本研究的主要结果如下:1.绵羊MYLK4及MTPN基因生物信息学分析利用绵羊MYLK4、MTPN基因核苷酸序列数据,对两个基因编码的氨基酸序列进行理化性质分析,研究表明前者编码的产物为不稳定的蛋白,而后者编码的产物则为稳定的蛋白。对MYLK4、MTPN跨膜结构域进行预测,没有发现跨膜结构域的存在;在两个基因编码蛋白质的亲/疏水性分析中,都表现出了很强的亲水性,证明MYLK4、MTPN皆不属于跨膜蛋白质。在两个基因的多序列比对和进化分析中发现MYLK4基因和羚羊、山羊的亲缘关系最近,与虎鲸和海豚的最远;绵羊MTPN和山羊亲缘关系最近,与猩猩和人类的最远,进而说明MYLK4、MTPN具有高度的保守性,但存在一定的种属特异性,不同物种间保守性不高。在绵羊MYLK4基因、MTPN基因SNP突变的挖掘中共筛选了14个可能影响绵羊生长发育的SNP位点,其中MYLK4基因有6个多态性变异位点,MTPN基因有8个多态性位点,并在后续实验中验证14个SNP位点与绵羊生长性状的相关性。2.MYLK4基因多态性及其与绵羊主要生长发育性状的关联分析对三种绵羊(共1557只)MYLK4基因多态性与生长性状的关联分析,最终筛选到2个对生长性状有显著影响的多态位点(g.50049402 G>C、g.50049360 C>G),在g.50049402 G>C中等位基因C为优势等位基因,CC为优势基因型,此多态位点对于绵羊的胸围、管围、胸宽以及体高有显著影响(P<0.05);在g.50049360 C>G中等位基因G为优势等位基因,GG为优势基因型,此多态位点对于绵羊的体斜长、胸深以及胸围有显著影响(P<0.05)。3.MTPN基因多态性及其与绵羊主要生长发育性状的关联分析对三种绵羊(共1557只)MTPN基因多态性与生长性状的关联分析,最终确定了1个对生长性状有显著影响的多态位点g.101185485 G>A,此多态位点的等位基因A为优势等位基因,AA为优势基因型,并显著影响绵羊的体高、胸围、管围等体尺性状。综上,本研究对两个候选基因MYLK4、MTPN基因编码的氨基酸序列进行理化性质分析、挖掘并鉴定了影响绵羊关键生长性状的分子标记,以期为MYLK4基因和MTPN基因在绵羊中的后续研究提供依据,为更加精准高效的绵羊分子标记辅助选择育种提供支持。
其他文献
牦牛复杂的混合型毛被结构及绒毛的季节性生长,将有助于其在高寒高海拔地区生存。毛囊作为毛绒产生的微型器官,不断经历退行期、休止期和生长期三个阶段。毛囊的持续再生循环是一个十分复杂的过程,涉及不同类型的细胞相互作用来共同调控毛囊结构的形成。单细胞转录组测序(single cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术可以在不同组织器官单细胞水平突出细胞异质性。因此,研究毛囊中细胞类型
学位
OLR1基因调控乳腺上皮细胞某些蛋白内化的相关机制和免疫反应,且主要在奶牛乳腺组织表达。为挖掘OLR1基因与奶牛产奶性能的相关关系,本研究以宁夏产区某规模化奶牛场中国荷斯坦牛为研究对象,收集产奶性能测定数据,采用DNA直接测序和PCR-SSCP分型技术对OLR1基因遗传多态性进行检测,并利用SPSS25.0一般线性模型中的单因素方差分析和邓肯法多重比较法探讨OLR1基因突变位点与产奶性状之间的相关
学位
喹啉结构是由吡啶环和苯环组成的稠环系,由于其官能团的多样性和形成各种分子间相互作用的能力,在超分子化学中显示出巨大的潜力。超分子化学是一个多学科相互交融的研究领域,专注于分子之间的非共价相互作用以及它们如何影响更大、更复杂结构的形成。在本文中,回顾了喹啉衍生物超分子化学的最新进展。讨论了这些分子可以形成的各种分子间相互作用,包括氢键、π···π堆积和金属配位,以及如何利用这些相互作用来创建超分子结
学位
牛病毒性腹泻病毒(Bovine viral diarrhea virus,BVDV)对我国养牛产业的威胁不容小觑,持续关注牛源BVDV毒株的生物学和遗传学特征有助于我们动态掌握此种病毒对于牛饲养和生产的潜在威胁。目前,BVDV主要以疫苗免疫为主,没有一个有效的预防和治疗的方法,需要从病毒感染及复制机制方面有一个更深的认识。BVDV NS5A可以结合病毒5′-UTR,并与3′-UTR互作诱发氧化应激
学位
溃疡性结肠炎(Ulcerative colitis,UC)是一种发于结肠黏膜及黏膜下层的炎症性肠病,表现为肠道黏膜屏障破坏、免疫紊乱和肠道菌群失调等。目前治疗UC的临床药物主要有磺胺吡啶盐、5-氨基水杨酸、皮质类固醇和钙调磷酸酶抑制剂等,但长期使用会有严重的副作用。近年来,单独的益生菌、膳食纤维(Dietary fiber,DF)作为UC防治方法被广泛研究,但发现治疗效果缓慢,未能满足UC治疗的要
学位
牦牛乳因高营养的特色品质,决定其产品具有极好的开发潜力。曲拉和酥油独特的风味和富含营养物质,成为我国传统特色牦牛乳制品,由于牦牛乳制品的品质与产地密切相关,不同来源的牦牛乳制品品质差异较大,极大地影响了消费者的购买信心,影响其产业发展。目前,对不同产地特色牦牛乳制品的差异性研究还未建立起有效的品质评价体系及产地溯源模型。因此,构建牦牛乳制品产品质量安全溯源体系,可实现牦牛乳制品产地的可追溯性,保障
学位
<正>党的二十大报告指出:“继续推进实践基础上的理论创新,首先要把握好习近平新时代中国特色社会主义思想的世界观和方法论,坚持好、运用好贯穿其中的立场观点方法。”党的二十大报告用“六个必须坚持”深刻阐述了推进理论创新的科学方法、正确路径,深刻揭示了习近平新时代中国特色社会主义思想的理论品格和鲜明特质,为把握好、运用好这一科学理论的思想精髓,进一步提高全党马克思主义水平提供了“金钥匙”,为继续推进党的
期刊
灌溉量和施磷量是紫花苜蓿(Medicago sativa)栽培草地稳产的关键因素。为探明适合紫花苜蓿优质高产的最佳水磷耦合配比,进一步阐明水磷耦合促进植物节水保收的内在机理,为我国干旱半干旱地区紫花苜蓿栽培草地的水肥协同管理提供科学依据。本研究采用温室盆栽试验分析了不同灌溉量(40%~45%、60%~65%、80%~85%的土壤饱和含水量)和施磷量(0、64、127、191 mg/kg)耦合对紫花
学位
<正>在工程项目风险管理中如何有效应用内部控制审计,使其发挥最大价值,一直是学者、企业负责人关注的热点。究其原因主要有三方面:一是企业工程项目风险管理的需求不断上升,企业的生存发展决定它们必须直面风险管理活动并进行科学管理;二是有些企业内部审计工作还处于财务审计阶段,审计工作很难延伸到整个企业的风险管控体系,
期刊
由于人口增加,越来越多不同肉类和肉制品消费的同时,也带来了大量的动物骨副产物,全球动物骨废物普遍增加。但每年都有大量的动物骨都被用于加工低端产品或直接被遗弃,使得这一资源未得到有效利用,造成大量浪费。近年来随着畜牧业的快速发展,将废弃动物骨作为异种骨用来研究骨修复材料被认为是一种可持续的策略。异种、异体骨修复材料主要通过煅烧法来去除其免疫原性,同时保留骨的良好成骨诱导性。不同煅烧条件下,其主要构成
学位