基于数据挖掘和网络药理学探讨放射性肠炎灌肠方用药规律及机制

来源 :江西中医药大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fangzhang004
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研究目的:(1)通过收集数据库中采用中药灌肠治疗放射性肠炎的文献,进行筛选归纳后,借助数据挖掘技术,分析中药处方的用药频率、类别、性味归经和组方用药的规律,为临床中医药组方治疗放射性肠炎提供参考。(2)运用网络药理学方法,通过核心药组治疗放射性肠炎的潜在活性成分、核心靶标及主要信号通路,阐明其可能发挥的作用机制,以期为中医药在治疗放射性肠炎方面积累更多的经验,获得更多的研究资料。研究方法:(1)数据挖掘:中药灌肠治疗放射性肠炎的临床观察文献,检索于中国知网(CNKI)、万方(wanfang database)、维普(VIP database)和中国生物医学文献数据库(CBMdisc)。依据相关的纳入、排除标准,筛选出其中符合标准的文献。将得到的文献资料中的处方信息提取出来,录入Excel 2019中创建数据库,对每个中药的功效分类、药性、药味及归经进行整理、统计并分析,使用SPSS Statistics 26.0、SPSS Modeler 18.0软件对高频药物进行联规则分析、聚类分析、因子分析。(2)网络药理学:在数据挖掘中频次使用最高的5个药物(地榆、白及、黄连、黄柏、白头翁)在关联规则、聚类分析、因子分析中,也都表现出极强的相关性,故将这5个药物作为放射性肠炎的核心药组进行网络药理学分析。运用TCMSP数据库对“地榆、白及、黄连、黄柏、白头翁”的活性成分及相关靶点进行筛选。在Gene Card、OMIM、Pharm Gkb和Drug Bank数据库中搜索与疾病相关的靶基因,使用cytoscape_V3.8.0制作药物活性成分-靶点-放射性肠炎靶点网络图。使用STRING数据库制作PPI图,使用R语言及程序包对核心药组治疗放射性肠炎的靶点蛋白进行GO功能富集分析以及KEGG信号通路分析,研究核心药组在放射性肠炎治疗过程中可能发挥的作用机制。选取核心药组中的主要活性成分与核心靶点进行分子对接并计算出结合能,通过Pub Chem网站、Chem3D软件得到核心活性成分3D结构的小分子配体,使用Uni Prot、PDB网站以及Py MOL软件获取去除了水分子和原始配体的核心靶点蛋白,将其作为蛋白受体,运用Auto Dock Tools、Py MOL软件进行分子对接并计算出结合能,并将部分结果进行可视化。结果:(1)在本研究中,排除标准后共纳入文献138篇,最终纳入中药处方113首,共含药品147种,累计频次1069次,其中频数≥17的药品有22种,将其作为高频药物,前10种为地榆(65次)、白及(55次)、黄连(51次)、黄柏(45次)、白头翁(33次)、甘草(32次)、黄芪(31次)、败酱草(28次)、白术(27次)以及槐花(27次)。用药分类主要以清热药(33.86%)、止血药(20.77%)、补虚药(16.18%)和活血化瘀药(5.61%)为主,四气频率由高到低依次为寒、温、平、凉、热性,药味频率由高到低依次为苦、甘、辛、涩、酸、咸、淡味,归经以肝、胃、脾、大肠、肺经为主。(2)在高频药物关联规则分析中发现,按照置信度大小进行排序,相关性程度最高的药物组合为为白及-大黄、地榆,其次为白术-黄芪、甘草,地榆-败酱草,白头翁-秦皮、黄柏以及黄连-黄芩。在高频药物聚类分析中,结合中医药理论分析最终得到新方组合7个,分别为C1:黄芪、白术;C2:木香、白芍、当归;C3:黄连、黄芩、甘草;C4:败酱草、薏苡仁、地榆、槐花、仙鹤草;C5:白及、三七、白花蛇舌草、大黄;C6:白头翁、秦皮、黄柏;C7:苦参、马齿苋。通过主成分法进行因子分析,最终选取9个公因子,提取其中7类,分别为地榆、败酱草、仙鹤草;薏苡仁、黄连、甘草、木香、白芍;黄芪、白术;白头翁、秦皮;三七、大黄;白及、槐花、白花蛇舌草;当归、黄芩。(3)在TCMSP数据库中共得到核心药组的有效成分84种,作用靶点共2908个,其中对放射性肠炎发挥治疗作用的活性成分主要为槲皮素、山奈酚、异鼠李素、β-谷甾醇、豆甾醇、异紫堇杷明碱、(S)-四氢小檗碱等。在四大数据库中筛选得到5747个疾病靶基因,制作Venn图得到药物-疾病交集基因161个,运用Cytoscape软件重新构建子网络后,得到7个治疗放射性肠炎的核心靶点,分别为JUN、MAPK1、RELA、MAPK14、FOS、ESR1、IL6。通过GO功能富集分析,共获得2603条GO条目,其中生物过程(2350条)方面主要是与脂多糖、细菌源分子以及药物的关系;细胞组成(33条)方面主要是与膜筏、膜微区和膜区的关系;分子功能方面主要是与DNA结合转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异性和细胞因子受体结合的关系。在KEGG信号通路分析中,与核心药组治疗放射性肠炎有关的信号通路共有175条,其中相关性最高的为AGE-RAGE、IL-17、TNF和toll样受体信号通路等。分子对接结果显示7个核心蛋白和7个主要活性成分结合能除异鼠李素与RELA结合能为-5.9kcal/mol外,其他均≤-6.0kcal/mol,证明了核心活性成分与核心蛋白结合的稳定性,并进一步验证了网络药理学的结果。结论:1.中药灌肠治疗放射性肠炎主要从“清热燥湿”、“凉血解毒”并加以扶正为治则,故用药多以清热燥湿、凉血解毒、祛瘀止痛药物为主的地榆、白及、黄芩、黄柏、白头翁等,并加以扶正之黄芪、白术、当归等,对临床组方用药提供参考价值。2.通过对“地榆、白及、黄连、黄柏、白头翁”多成分、多靶点、多通路的复杂网络分析,初步推测中药灌肠治疗放射性肠炎的作用机制可能主要是通过JUN、MAPK1、RELA、MAPK14、FOS、ESR1、IL-6靶点蛋白调节AGE-RAGE、IL-17、TNF、toll样受体信号通路来参与调控肠道环境稳定性、控制肠道炎症反应、保护肠黏膜屏障等发挥作用,为进一步动物实验研究提供依据。
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