我国房地产市场自1998年开始进行市场化改革后,发展迅猛,房地产已成为一种具有投资属性和一般商品属性的商品,毋庸置疑,房地产已经成为拉动我国经济增长的支柱性产业。我国在上世纪九十年代初分别成立了上海证券交易所与深圳证券交易所,这标志着股票市场在我国的正式诞生,经过近三十年的发展和完善,在金融市场和经济发展中起着越来越重要的作用。由此,为使我国经济健康快速发展,对这两个市场的波动关联性进行研究具有必要性。本文基于房地产市场及股票市场的特点,运用资产组合效应理论、替代效应理论、财富效应理论和信贷扩张效应理论和宏观经济传导理论对房地产市场与股票市场的波动关联性进行了理论分析,并对两个市场相关联的传导机制进行了论述,认为二者之间具有较强的关联性。在此基础上,结合我国房地产市场和股票市场的现实运行情况,剖析了我国房地产市场和股票市场的发展现状和不足之处,总结出以下特点:房地产价格持续上涨、各区域发展不平衡;股票市场市值快速增长、价格波动剧烈。为了进一步佐证上述定性分析的结论,本文选取上证综指和深证成指、全国房地产开发业综合景气指数和全国商品房平均销售价格分别作为房地产市场和股票市场的代理变量,利用1998—2018年的月度数据,通过建立VAR模型,运用脉冲响应分析、格兰杰因果关系检验以及协整检验的方法进行了实证计量分析。研究结论显示:我国房地产市场与股票市场的波动之间存在较显著的因果关系,这种显著的关系表现为长期的正相关关系;股票市场的波动在房地产市场波动与股票市场波动的关联关系中起着主导的作用,房地产市场波动会在较大程度上且较长时期内受到股票市场波动的正向影响,但是股票市场波动大体上是受到房地产市场波动的负向影响;在长期内,我国房地产市场的波动与股票市场的波动之间存在着较稳定的协整关系。最后,根据研究结论并结合两个市场的现状与不足,借鉴国际经验,结合我国国情,提出了完善我国房地产市场及股票市场发展的政策建议:把握经济运行周期规律,综合运用多种调控手段;加大金融监管力度,健全监督管理体系;创新房地产市场的发展模式,建立多层次化的住房供给体系;鼓励金融发展与金融创新,发展多元化投资产品;加强信贷潜在风险评估和控制,建立风险传导监控机制。