交通运输业作为国民经济的基础性产业,是国民经济的重要组成部分。研究“营改增”后交通运输业存在的问题,不仅对促进税制体系的完善以及实现税收的合理化和科学化具有重要的指导意义,还有助于优化产业结构、促进交通运输业的良性发展。本文在查阅大量文献资料的基础上,收集了交通运输业中符合条件的65个上市公司财务报表的2010年-2017年的相关数据,并采用对比分析法、定量分析法分析交通运输业“营改增”前后税负的变化情况。本文根据“营改增”的进程从四个阶段分析“营改增”对企业的影响:第一阶段为2012年1月1日实行“营改增”的企业,第二阶段为2012年9月1日至2012年12月1日实行“营改增”的企业,第三阶段为2013年8月1日实行“营改增”的企业,第四阶段为2014年1月1日实行“营改增”的企业。在四个阶段中,分别利用财务报表的相关数据对企业的流转税、所得税和总税收负担率进行测算,以便更加全面的反映“营改增”对企业税负变化的影响。除了对同一企业的税负变化进行纵向比较外,本文还将交通运输业与其相关行业的税负变化情况进行横向比较。本文通过分析得出结论:第一,从交通运输业总体角度而言,30.77%的企业总税负上升,69.23%的企业总税负下降。在税负上升的企业中,道路运输业占55%,水上运输业占30%,航空运输业占15%。第二,从交通运输业不同类别企业的角度分析,道路运输业中税负增加的企业占39.29%,水上运输业中税负增加的企业占25%,航空运输业中税负增加的企业占30%。税负上升会对经济社会产生许多不利的影响,包括企业的生产规模下降、失业率上升和产业结构不合理等。而企业税负上升的原因包括增值税税率较高;可抵扣的进项税额的范围较少;固定资产的更新周期较长;增值税专用发票的取得较难。为了更好地解决税负上升的问题,笔者分别提出对政府和对企业的建议。对政府的建议包括降低一般纳税人的认定标准;简化税率结构,降低税率;扩大可以抵扣的进项税额的范围;提高税收征管能力。对企业的建议包括加强对相关业务人员的培训;建立健全财务核算体系;合理选择纳税人的身份;合理地进行纳税筹划。