基于GenoList的细菌数据库构建

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该文主要工作就是基于GenoList构建三个细菌:即泉生热孢菌、苟养木杆菌和钩端螺旋体的基因组注释信息数据库.泉生热孢菌是中国测定的第一个嗜热菌,是研究生物在极端环境条件下生命活动的一个重要物种.此外,引起研究人员兴趣的是,作为革兰氏阴性菌的泉生热孢菌与经典的革兰氏阳性菌有很多相似性,并缺失了某些阴性菌的特性.苟养木杆菌是一个木质部依赖细菌,它对柑桔等经济作物危害巨大,到目前还没有找到有效的处理方法.钩端螺旋体是螺旋体病的致病菌,在热带和亚热带一些国家里,细螺旋体病严重威胁着人们的健康.构建这三个数据库的同时,对GenoList本身也进行了一些改进.用开放源代码的MySQL取代Sybase作为数据库管理系统,设计了功能更为全面的解析器,并添加了数据维护模块.这些工作将为GenoList的进一步发展打下基础.
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