肾透明细胞癌3p21.3区抑癌基因与肾组织特异性hTERT抑制因子的初步筛选研究

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目的:检测hTERT及6个候选基因在肾透明细胞癌与正常肾组织中的表达水平,筛选位于人3号染色体短臂(3p21.3)上潜在的肾组织特异性hTERT抑制因子和/或肾透明细胞癌抑癌基因。方法:1.参考文献报道并结合生物信息学分析方法,从3p21.3区筛选出6个候选基因(LRRC2、SETD2、ALS2CL、APEH、SEMA3B、SLC38A3)为研究对象;收集人肾透明细胞癌手术病例标本(26例),提取总RNA,利用RT-PCR技术及quantitative real-timePCR(QPCR)技术检测hTERT与各候选基因在肾透明细胞癌与配对正常肾组织标本中的表达。2.综合RT-PCR与实时定量PCR两种检测方法选出可能的抑癌候选基因,行免疫组织化学染色及Western Blot蛋白检测,进一步验证其表达水平的差异。结果:1.以正常肾组织作为对照,RT-PCR示hTERT基因在69.23%(18/26)肾透明细胞癌组织中表达阳性,两株肾透明细胞癌细胞株786/O与SN12亦为阳性表达;QPCR示hTERT基因mRNA的相对表达量为0.070~9.640,中位数4.192,与正常肾组织相较,其中76.92%(20/26)的肾透明细胞癌组织标本中hTERT基因相对表达量显著上调,p<0.05,有统计学意义。786/0中hTERT基因相对表达量2.38±0.21,SN12中为4.31±0.33,与正常对照肾组织相较,其表达差异显著,p<0.05,有统计学意义。2.在6个候选抑癌基因中,RT-PCR结果显示:LRRC2(53.85%<14/26>)、SETD2(46.15%<12/26>)、ALS2CL(53.85%<14/26>)、APEH(61.54%<16/26>)与SEMA3B(30.77%<8/26>)在ccRCC组织标本中表达下调或缺失(P<0.05),而SLC38A3的表达无显著差异(P>0.05);实时定量QPCR示LRRC2:相对表达量0~3.560,中位数0.791;SETD2:相对表达量为0.010~1.840,中位数为0.525;ALS2CL:相对表达量0~2.504,中位数0.162;APEH:相对表达量为0~2.427,中位数0.258;SEMA3B:相对表达量为0.020~5.420,中位数1.065。这5个基因在肾透明细胞癌组织中表达显著下调的比率分别为46.15%(12/26)、50.00%(13/26)、65.38%(17/26)、69.23%(18/26)、38.46%(10/26),而SLC38A3基因在肾透明细胞癌组织中相对表达量为0.640~3.010,中位数为1.579,与正常肾组织相比较,差异无显著性(P>0.05),与前述RT-PCR检测结果基本相符。3.以实时定量PCR为标准,结合第一部分hTERT基因实时定量PCR结果,在hTERT高表达的20例肾透明细胞癌组织标本中,LRRC2对应下调的比例为35%(7/20);SETD2对应下调的比例为55%(11/20);ALS2CL对应下调的比例为55%(11/20);APEH基因对应下调的比例为60%(12/20);SEMA3B基因对应下调的比例为40%(8/20)。hTERT与上述5个基因相关性的统计学分析显示,SETD2、ALS2CL、APEH三个基因在肾透明细胞癌中的下调与hTERT的上调表达相关性有统计学意义(检验p值分别为0.0438、0.0021、0.0008,<0.05),而LRRC2、SEMA3B与hTERT的差异表达其相关性检验无意义(p值分别为0.0803、0.2294,>0.05)。4.对APEH基因进行了进一步的研究,免疫组织化学染色显示所有正常对照组为强阳性表达,而80.77%(21/26)的肾透明细胞癌组织呈阴性或弱阳性表达,而随机选取16例配对肾癌与正常肾组织行WesternBlot蛋白检测示,相较正常对照组,62.5%(10/16)的肾透明细胞癌组织标本APEH蛋白表达下调,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:大多数肾透明细胞癌存在端粒酶激活,且与hTERT(端粒酶的限速酶成分)密切关联;SETD2在肾透明细胞癌ccRCC中低表达,与国外新近发表的文献报道一致;3p21.3区基因LRRC2、ALS2CL、APEH、SEMA3B在肾透明细胞癌中低表达尤其是APEH,可能参与肾透明细胞癌的发生发展,其生物学活性有待进一步深入研究。
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