细胞分泌相关蛋白质信息管理系统的设计与实现

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细胞分泌是生物体的基本生理过程之一,负责信息传递,与多种细胞功能相关。整个分泌过程涉及一系列复杂的分子活动,其中多数分子为蛋白质,这些蛋白质的相互作用、分子构象变化和膜融合之间的关系等都有待深入研究。但是,己有的研究数据大部分都分散于文献中,或收录于一些综合的生物信息数据库中,因此难以对数据进行方便的检索和系统分析,这都不利于细胞分泌研究的开展。因此,很有必要对己有数据进行挖掘和汇总,构建专门的细胞分泌相关蛋白质信息管理系统,为用户提供浏览和查询等服务,以便为细胞分泌相关研究的进一步开展提供支持。以细胞分泌过程的分子生物学研究为背景,构建了该过程相关蛋白质分子的信息管理系统。数据主要从文献提取并通过其他生物信息数据库进行补充和完善,在数据收集过程中对蛋白质进行了分类。按照软件工程要领,分析了系统的可行性。根据对细胞分泌和其他生物数据库的了解,了解了系统的功能和性能需求。用例图通过UML建模语言设计。根据需求将系统分为了浏览、查询、序列比对、相互作用网络和下载等五个功能模块,根据E-R图设计了所需数据库表,并在此基础上选择合适的技术进行后续开发。蛋白质信息管理系统的实现采用了J2EE体系结构、MVC架构和MySQL数据库管理系统,为降低系统耦合度并简化编码过程,使用了Spring和MyBatis框架技术。系统提供了多种浏览和查询方法,除了包含每个蛋白质的详细信息外,还包含相互作用的详细信息,通过JavaScript动态生成互相作用的网络图,用户可以更直观地看到参与其中的蛋白质的情况。细胞分泌相关蛋白质信息管理系统整体采用B/S架构,采用了J2EE架构的分层思想。系统可以通过web页面使用,提供了相关的文字信息,并以图表等形式显示。系统层次结构清晰,有良好的可移植性和跨平台性,界面友好,操作简单,功能完善,是一个合理的生物分子信息管理系统。
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