国内外财务舞弊的层出不穷让我们开始怀疑财务报告的可靠性。单纯的财务报表审计无法完全实现对公司投资者与管理者这种契约关系执行情况的有效监督。内部控制作为公司治理的关键环节和经营管理的重要内容,已经成为经济、管理领域的一个热门课题。内部控制审计的应运而生,不仅是财务报告可信性的重要保障,而且可以使投资者重拾对资本市场的信心,促进市场经济的良好秩序。美国相继颁布了SOX法案、ASN0.2、ASNO.5,强化了治理层、管理层对财务报告内部控制有效性的责任；明确了审计师对财务报告内部控制的审计责任,内部控制审计从此成为注册会计师的一项法定业务。我国在内部控制制度建设方面和内部控制审计方面都起步较晚,2008年以来相继出台了基本规范及配套指引、实施意见、内部控制审计底稿编制指南等,为我国上市公司分类分批开展内部控制审计提供了指导。内部控制审计理论研究滞后于审计实务发展决定了内部控制审计研究的必要性。开展企业内部控制审计的理论研究具有现实和长远的意义：一、有助于注册会计师解决审计实务操作问题,规范审计执业水平；二、可以促进我国内部控制审计准则体系的完善。本文在理论分析部分研究了美国、日本及我国的内部控制审计制度化进程,揭示了在内部控制审计变迁中的实践经验、准则改进、发展趋势等。然后采用调查分析的方法,以内部控制审计报告为依托,分析了我国内部控制审计自首年实施以来,2011年和2012年的内部控制审计情况。在此基础归纳了当前我国内部控制审计实务中存在的问题,采用对比分析的方式对其进行了剖析,并给出了相应的见解和建议,探讨了内部控制审计与年报审计进行整合的趋势及可能性。案例部分结合实践经验,说明了实务中整合审计的思路及采用的自上而下审计的方法。论文结尾针对我国内部控制审计存在的问题,采用区分不同主体的方式,有针对性地提出了几点建议,期待更好地完善、规范我国内部控制审计的开展。