煤炭资源对国民经济的发展具有十分重要的作用，是国民经济发展的物质基础，也是可持续发展链条上的重要一环，税收政策是政府对煤炭行业进行干预的一种重要手段，合理的税费可以促进煤炭资源的有效利用，提高煤炭企业的竞争力。但是目前我国煤炭税费体系存在着很多问题，以鄂尔多斯地区为例，煤炭企业的税收体制和结构的不合理，主要是过分强调税收的收入功能，而忽视税收的调节功能，而分配功能上又存在明显的不公平，在财力分配上欠公平，无法满足煤炭资源开采地经济社会发展和煤炭产业发展现状的要求，进而造成煤炭资源开采地环境治理、民生发展等一系列的社会问题；在具体税种方面来说，煤炭企业增值税税率和企业所得税税率过高，资源税征税方法和征税结构不合理，相关收费及基金征收名目众多，直接导致税费负担过重，煤炭市场信号失灵，影响了市场配置资源机制的形成。本文主要采用比较研究,定量分析等方法，以鄂尔多斯地区煤炭行业为例，分析了税费体制中存在的问题；最后提出了煤炭税费体制改革的政策建议，如适当降低增值税税率；资源税实行从价定比计征，提高地方政府在资源收益中分享的比例；简化税制，建立以房地产税为主的地方财税制度；合理划分中央和地方在税收上的共享比例等，以解决煤炭企业和以资源型城市经济的可持续发展和企业的转型。