电子商务企业能否高效运营关键在于实现信息流、资金流、商流、物流的有机整合,然而现阶段我国物流水平相对不高,物流越来越成为制约电子商务企业发展的瓶颈,因此电子商务企业选择恰当的物流运营模式将有助于实现企业的物流低成本和高利润的追求目标。通过对电子商务企业分类的分析划定本文所研究的电子商务企业类型,经过对物流运营模式分类的分析和研究,本文将电子商务企业运用的物流运营模式划分为完全自营、完全外包、物流联盟三种形式,首先从电子商务企业的物流特点出发,结合对以往物流运营模式选择影响因素相关研究的分析,着重考虑三种物流运营模式各自的适用特点和优劣,制定了针对三种物流运营模式的三种评价指标体系,从而使其区别于以往对物流运营模式选择研究时所制定的评价指标体系,这也是本文的特色所在；然后鉴于三种评价指标体系指标个数多、部分指标只能定性评估、难以定量计算的特点,结合集值统计方法和多层次灰色评价法的原理和特点,进而提出了基于集值统计和多层次灰色评价法相结合的综合评价模型,并详细讲述了该综合评价模型的构建过程和具体的计算过程；最后通过算例分析实现对模型的检验,运用Matlab对模型编程求解,并对综合评价模型进行灵敏度分析。